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Enregistrement W4310368196 · doi:10.1038/s42003-022-04267-y

A meta-analysis of pre-pregnancy maternal body mass index and placental DNA methylation identifies 27 CpG sites with implications for mother-child health

2022· review· en· W4310368196 sur OpenAlexaff
Nora Fernández‐Jiménez, Ruby Fore, Ariadna Cilleros‐Portet, Johanna Lepeule, Patrice Perron, Tuomas Kvist, Fu‐Ying Tian, Corina Lesseur, Alexandra M. Binder, Manuel Lozano, Jordi Martorell‐Marugán, Yuk Jing Loke, Kelly M. Bakulski, Yihui Zhu, Anne Forhan, Sara Sammallahti, Todd M. Everson, Jia Chen, Karin B. Michels, Thalía Belmonte, Pedro Carmona‐Sáez, Jane Halliday, M. Daniele Fallin, Janine M. LaSalle, Jörg Tost, Darina Czamara, Mariana F. Fernández, Antonio Gómez‐Martín, Jeffrey M. Craig, Beatriz González-Alzaga, Rebecca J. Schmidt, John Dou, Evelyne Muggli, Marina Lacasaña, Martine Vrijheid, Carmen J. Marsit, Margaret R. Karagas, Katri Räikkönen, Luigi Bouchard, Barbara Heude, Loreto Santa‐Marina, Mariona Bustamante, Marie‐France Hivert, José Ramón Bilbao

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2022
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Saguenay–Lac-Saint-JeanUniversité de SherbrookeCentre Hospitalier Universitaire de Sherbrooke
Organismes subventionnairesEuropean Regional Development FundJohns Hopkins Bloomberg School of Public HealthGenome Center, University of California, DavisUniversity of California, DavisNational Institute of Environmental Health SciencesUniversité de ParisUniversity of California Davis School of MedicineInstitut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'EnvironnementInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleFundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunitat ValencianaUniversidad de GranadaOsasun Saila, Eusko JaurlaritzakoUniversity of California, Los AngelesCentro Pfizer-Universidad de Granada-Junta de Andalucía de Genómica e Investigación OncológicSchool of Public Health, University of MichiganUniversitat Jaume IEuskal Herriko UnibertsitateaMinisterio de Economía y CompetitividadDeakin UniversityCentre d'Imagerie BioMédicaleJohns Hopkins UniversityMurdoch Children's Research InstituteUniversitat de ValènciaJoint Programming Initiative A healthy diet for a healthy lifeChildren’s Hospital of Wisconsin Research InstitutePfizerHelsingin YliopistoAlbert-Ludwigs-Universität FreiburgEmory UniversityCentre National de la Recherche ScientifiqueInstituto de Salud Carlos IIIEuropean Association of Social Psychology
Mots-clésCpG siteDNA methylationMethylationMeta-analysisBody mass indexObstetricsPregnancyPlacentaBiologyMedicineGeneticsDNAFetusGeneInternal medicineGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Higher maternal pre-pregnancy body mass index (ppBMI) is associated with increased neonatal morbidity, as well as with pregnancy complications and metabolic outcomes in offspring later in life. The placenta is a key organ in fetal development and has been proposed to act as a mediator between the mother and different health outcomes in children. The overall aim of the present work is to investigate the association of ppBMI with epigenome-wide placental DNA methylation (DNAm) in 10 studies from the PACE consortium, amounting to 2631 mother-child pairs. We identify 27 CpG sites at which we observe placental DNAm variations of up to 2.0% per 10 ppBMI-unit. The CpGs that are differentially methylated in placenta do not overlap with CpGs identified in previous studies in cord blood DNAm related to ppBMI. Many of the identified CpGs are located in open sea regions, are often close to obesity-related genes such as GPX1 and LGR4 and altogether, are enriched in cancer and oxidative stress pathways. Our findings suggest that placental DNAm could be one of the mechanisms by which maternal obesity is associated with metabolic health outcomes in newborns and children, although further studies will be needed in order to corroborate these findings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,897
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,131
Tête enseignante GPT0,401
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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