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Enregistrement W4310370069 · doi:10.1016/j.ebiom.2022.104373

Immune-based classification of HPV-associated oropharyngeal cancer with implications for biomarker-driven treatment de-intensification

2022· article· en· W4310370069 sur OpenAlexafffund
Peter YF. Zeng, Matthew J. Cecchini, John W. Barrett, Matthew Shammas‐Toma, Loris De Cecco, Mara Serena Serafini, Stefano Cavalieri, Lisa Licitra, Frank Hoebers, Ruud H. Brakenhoff, C. René Leemans, Kathrin Scheckenbach, Tito Poli, Xiaowei Wang, Xinyi Liu, Francisco Laxague, Eitan Prisman, Catherine F. Poh, Pinaki Bose, Joseph C. Dort, Mushfiq Hassan Shaikh, Sarah E.B. Ryan, Alice Dawson, Mohammed Imran Khan, Christopher J. Howlett, William Stecho, Paul Plantinga, Sabrina Daniela da Silva, Michael Hier, Halema Khan, Danielle MacNeil, Adrian Mendez, John Yoo, Kevin Fung, Pencilla Lang, Eric Winquist, David A. Palma, Hedyeh Ziai, Antonio L. Amelio, Shawn Li, Paul C. Boutros, Joe S. Mymryk, Anthony C. Nichols

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of CalgaryMcGill UniversityUniversity of British ColumbiaVancouver General HospitalWestern University
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchCanadian Institutes of Health ResearchFondazione Italiana per la Ricerca sul CancroEuropean CommissionAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroPhysicians' Services Incorporated FoundationNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthYale University
Mots-clésBiomarkerImmune systemCancerMedicineImmunologyOncologyBiologyInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: OPSCC patients. METHODS: We created an immune score (UWO3) associated with survival outcomes in six independent cohorts comprising 906 patients, including blinded retrospective and prospective external validations. Two aggressive radiation de-escalation cohorts were used to assess the ability of UWO3 to identify patients who recur. Multivariate Cox models were used to assess the associations between the UWO3 immune class and outcomes. FINDINGS: ) and mixed (HR = 6.4, 95% CI: 2.2-18.7, P = 0.006) groups after adjusting for age, sex, smoking status, and AJCC8 clinical stage. Finally, UWO3 was able to identify patients from two small treatment de-escalation cohorts who remain disease-free after aggressive de-escalation to 30 Gy radiation. INTERPRETATION: OPSCC based on robust outcome prediction across six independent cohorts. Prospective de-escalation and intensification clinical trials are currently being planned. FUNDING: CIHR, European Union, and the NIH.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,861
Score d'incertitude au seuil0,445

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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