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Enregistrement W4310482580 · doi:10.1093/ofid/ofac645

Meeting the Challenges of Sepsis in Severe Coronavirus Disease 2019: A Call to Arms

2022· article· en· W4310482580 sur OpenAlexfundno aff
Thomas J. Walsh, Rick A. Bright, Aparna Ahuja, Matthew W. McCarthy, Richard A Marfuggi, Steven Q. Simpson

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntibiotic Use and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAllerganAmerican Medical Association FoundationShionogiSick Kids FoundationAstellas PharmaAmplyxGilead SciencesPfizer
Mots-clésMedicineSepsisIntensive care medicineDiseaseOrgan dysfunctionAntibioticsAntimicrobialCoronavirusImmunologyInternal medicineInfectious disease (medical specialty)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sepsis is a life-threatening organ dysfunction that is caused by a dysregulated host response to infection. Sepsis may be caused by bacterial, fungal, or viral pathogens. The clinical manifestations exhibited by patients with severe coronavirus disease 2019 (COVID-19)-related sepsis overlap with those exhibited by patients with sepsis from secondary bacterial or fungal infections and can include an altered mental status, dyspnea, reduced urine output, tachycardia, and hypotension. Critically ill patients hospitalized with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 infections have increased risk for secondary bacterial and fungal infections. The same risk factors that may predispose to sepsis and poor outcome from bloodstream infections (BSIs) converge in patients with severe COVID-19. Current diagnostic standards for distinguishing between (1) patients who are critically ill, septic, and have COVID-19 and (2) patients with sepsis from other causes leave healthcare providers with 2 suboptimal choices. The first choice is to empirically administer broad-spectrum, antimicrobial therapy for what may or may not be sepsis. Such treatment may not only be ineffective and inappropriate, but it also has the potential to cause harm. The development of better methods to identify and characterize antimicrobial susceptibility will guide more accurate therapeutic interventions and reduce the evolution of new antibiotic-resistant strains. The ideal diagnostic test should (1) be rapid and reliable, (2) have a lower limit of detection than blood culture, and (3) be able to detect a specific organism and drug sensitivity directly from a clinical specimen. Rapid direct detection of antimicrobial-resistant pathogens would allow targeted therapy and result in improved outcomes in patients with severe COVID-19 and sepsis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,029
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,070
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,154

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0290,070
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,003
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0030,009
Communication savante0,0120,024
Science ouverte0,0060,011
Intégrité de la recherche0,0250,039
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0260,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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