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Enregistrement W4310490360 · doi:10.3389/fpls.2022.1063988

Identification of QTL underlying the main stem related traits in a doubled haploid barley population

2022· article· en· W4310490360 sur OpenAlexaff
Anyong Zhang, Ting Zhao, Xue Hu, Yu Zhou, Yue An, Haiyi Pei, Dongfa Sun, Genlou Sun, Chengdao Li, Xifeng Ren

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueCrop Yield and Soil Fertility
Établissements canadiensSaint Mary's University
Organismes subventionnairesEarmarked Fund for China Agriculture Research System
Mots-clésBiologyQuantitative trait locusDoubled haploidyPaniclePlant stemPopulationAgronomyIntrogressionHordeum vulgareGeneticsGenePoaceae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lodging reduces grain yield in cereal crops. The height, diameter and strength of stem are crucial for lodging resistance, grain yield, and photosynthate transport in barley. Understanding the genetic basis of stem benefits barley breeding. Here, we evaluated 13 stem related traits after 28 days of heading in a barley DH population in two consecutive years. Significant phenotypic correlations between lodging index (LI) and other stem traits were observed. Three mapping methods using the experimental data and the BLUP data, detected 27 stable and major QTLs, and 22 QTL clustered regions. Many QTLs were consistent with previously reported traits for grain filling rate, internodes, panicle and lodging resistance. Further, candidate genes were predicted for stable and major QTLs and were associated with plant development and adverse stress in the transition from vegetative stage to reproductive stage. This study provided potential genetic basis and new information for exploring barley stem morphology, and laid a foundation for map-based cloning and further fine mapping of these QTLs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,442
Score d'incertitude au seuil0,267

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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