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Enregistrement W4310537549 · doi:10.1101/2022.11.30.22282929

Genome-wide meta-analysis identifies novel maternal risk variants and enables polygenic prediction of preeclampsia and gestational hypertension

2022· preprint· en· W4310537549 sur OpenAlexaff
Michael C. Honigberg, Buu Truong, Raiyan R. Khan, Brenda Xiao, Laxmi Bhatta, Ha My T. Vy, Rafael F. Guerrero, Art Schuermans, Margaret Sunitha Selvaraj, Aniruddh P. Patel, Satoshi Koyama, So Mi Jemma Cho, Shamsudheen Karuthedath Vellarikkal, Mark Trinder, Sarah Urbut, Kathryn J. Gray, Ben Brumpton, Snehal Patil, Sebastian Zöllner, Mariah C. Antopia, Richa Saxena, Girish N. Nadkarni, Ron Do, Qi Yan, Itsik Pe’er, Shefali S. Verma, Rajat M. Gupta, David M. Haas, Hilary C. Martin, David A. van Heel, Triin Laisk, Pradeep Natarajan

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePregnancy and preeclampsia studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNorwegian Institute of Public HealthFaculty of Medicine and Health, University of SydneyMedical Research CouncilFakultet for medisin og helsevitenskap, Norges Teknisk-Naturvitenskapelige UniversitetMedical School, University of MichiganNational Institutes of HealthNorges ForskningsrådBelgian American Educational FoundationBarts CharityNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNorges Teknisk-Naturvitenskapelige UniversitetMassachusetts General HospitalHarvard CatalystStiftelsen Kristian Gerhard JebsenFondation LeducqUniversity of MichiganMaze TherapeuticsAlnylam PharmaceuticalsNovo NordiskKorea Health Industry Development InstituteNational Institute for Health and Care ResearchHelse Midt-NorgeGlaxoSmithKlineBristol-Myers SquibbSchool of Public Health, University of MichiganAmerican Heart Association
Mots-clésPreeclampsiaGestational hypertensionPregnancyGenome-wide association studyMedicineEclampsiaObstetricsBioinformaticsBiologyGeneticsSingle-nucleotide polymorphismGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Preeclampsia and gestational hypertension are common pregnancy complications associated with adverse maternal and offspring outcomes. Current tools for prediction, prevention, and treatment are limited. We tested the association of maternal DNA sequence variants with preeclampsia in 20,064 cases and 703,117 controls and with gestational hypertension in 11,027 cases and 412,788 controls across discovery and follow-up cohorts using multi-ancestry meta-analysis. Altogether, we identified 18 independent loci associated with preeclampsia/eclampsia and/or gestational hypertension, 12 of which are novel (e.g., MTHFR-CLCN6 , WNT3A , NPR3 , PGR , and RGL3 ), including two loci ( PLCE1 , FURIN ) identified in multi-trait analysis. Identified loci highlight the role of natriuretic peptide signaling, angiogenesis, renal glomerular function, trophoblast development, and immune dysregulation. We derived genome-wide polygenic risk scores that predicted preeclampsia/eclampsia and gestational hypertension in external datasets, independent of first trimester risk markers. Collectively, these findings provide mechanistic insights into the hypertensive disorders of pregnancy and advance pregnancy risk stratification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,009
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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