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Enregistrement W4310644815 · doi:10.1002/mgg3.2116

Further characterization of the 9q31 microdeletion phenotype; delineation of a common region of overlap containing <i>ZNF462</i>

2022· article· en· W4310644815 sur OpenAlexaff
Lauren Brady, Mark Ballantyne, John Duck, Thomas Fisker, Ryan Kleefman, Chumei Li, Landry Nfonsam, Lee‐Anne Schultz, Mark A. Tarnopolsky, M. Elizabeth McCready

Notice bibliographique

RevueMolecular Genetics & Genomic Medicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensHamilton Regional Laboratory Medicine ProgramMcMaster UniversityHamilton Health SciencesHealth Sciences Centre
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésPhenotypeMedicineGeneticsBioinformaticsGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Loss of function variants and whole gene deletions of ZNF462 has been associated with a novel phenotype of developmental delay/intellectual disability and distinctive facial features. Over two dozen cases have been reported to date and the condition is now known as Weiss-Kruszka syndrome (OMIM# 618619). There are several older reports in the literature and DECIPER detailing individuals with interstitial deletions of 9q31 involving the ZNF462 gene. Many of the characteristic facial features described in these microdeletion cases are similar to those who have been diagnosed with Weiss-Kruszka syndrome. METHODS: We describe three additional patients with overlapping 9q31 deletions and compare the phenotypes of the microdeletion cases reported in the literature to Weiss-Kruszka syndrome. RESULTS: Phenotypic overlap was observed between patients with 9q31 deletions and Weiss-Kruszka syndrome. Several additional features were noted in 9q31 deletion patients, including hearing loss, small head circumference, palate abnormalities and short stature. CONCLUSIONS: The common region of overlap of microdeletion cases implicates ZNF462 as the main driver of the recognizable 9q31 microdeletion phenotype. The observation of additional features in patients with 9q31 microdeletions that are not reported in Weiss-Kruszka syndrome further suggests that other genes from the 9q31 region likely act synergistically with ZNF462 to affect phenotypic expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,484

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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