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Enregistrement W4310700692 · doi:10.1002/hbm.26165

Fast three‐dimensional image generation for healthy brain aging using diffeomorphic registration

2022· article· en· W4310700692 sur OpenAlexfundno aff
Jingru Fu, Antonios Tzortzakakis, José Barroso, Eric Westman, Daniel Ferreira, Rodrigo Moreno

Notice bibliographique

RevueHuman Brain Mapping · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingCenter for Innovative MedicineEisai IncorporatedNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchGenentechNational Institutes of HealthIXICOH. Lundbeck A/SServierVINNOVATakeda Pharmaceuticals U.S.A.BarncancerfondenU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyChina Scholarship CouncilEisaiFundación CajaCanariasAlzheimer's AssociationStiftelsen för Gamla TjänarinnorFujirebio USPfizerBioClinicaBiogenNovartis Pharmaceuticals CorporationBristol-Myers SquibbAbbVieHjärnfondenF. Hoffmann-La RocheMerckAlzheimerfondenAlzheimer's Drug Discovery FoundationGE HealthcareAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNational Center for Advancing Translational SciencesDemensfondenMeso Scale Diagnostics
Mots-clésNeuroimagingArtificial intelligenceImage registrationMagnetic resonance imagingPattern recognition (psychology)Computer scienceComputer visionPsychologyImage (mathematics)NeuroscienceMedicineRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Predicting brain aging can help in the early detection and prognosis of neurodegenerative diseases. Longitudinal cohorts of healthy subjects scanned through magnetic resonance imaging (MRI) have been essential to understand the structural brain changes due to aging. However, these cohorts suffer from missing data due to logistic issues in the recruitment of subjects. This paper proposes a methodology for filling up missing data in longitudinal cohorts with anatomically plausible images that capture the subject‐specific aging process. The proposed methodology is developed within the framework of diffeomorphic registration. First, two novel modules are introduced within Synthmorph, a fast, state‐of‐the‐art deep learning‐based diffeomorphic registration method, to simulate the aging process between the first and last available MRI scan for each subject in three‐dimensional (3D). The use of image registration also makes the generated images plausible by construction. Second, we used six image similarity measurements to rearrange the generated images to the specific age range. Finally, we estimated the age of every generated image by using the assumption of linear brain decay in healthy subjects. The methodology was evaluated on 2662 T1‐weighted MRI scans from 796 healthy participants from 3 different longitudinal cohorts: Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative, Open Access Series of Imaging Studies‐3, and Group of Neuropsychological Studies of the Canary Islands (GENIC). In total, we generated 7548 images to simulate the access of a scan per subject every 6 months in these cohorts. We evaluated the quality of the synthetic images using six quantitative measurements and a qualitative assessment by an experienced neuroradiologist with state‐of‐the‐art results. The assumption of linear brain decay was accurate in these cohorts ( R 2 ∈ [.924, .940]). The experimental results show that the proposed methodology can produce anatomically plausible aging predictions that can be used to enhance longitudinal datasets. Compared to deep learning‐based generative methods, diffeomorphic registration is more likely to preserve the anatomy of the different structures of the brain, which makes it more appropriate for its use in clinical applications. The proposed methodology is able to efficiently simulate anatomically plausible 3D MRI scans of brain aging of healthy subjects from two images scanned at two different time points.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,968
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,204
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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