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Enregistrement W4310807794 · doi:10.21742/ijhit.2653-309x.2022.2.1.01

Extending the Power of Problem Oriented Medical Record with Disease Association Discovery: The Case Study of Empowering QL4POMR with OpenTargets

2022· article· en· W4310807794 sur OpenAlexafffund
Sabah Mohammed, Jinan Fiaidhi

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Hybrid Innovation Technologies · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensLakehead University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacs
Mots-clésHealth informaticsAssociation (psychology)InformaticsData scienceEvidence-based medicineComputer scienceMedical recordMedicinePsychologyAlternative medicinePublic healthEngineeringPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Medical informatics was profoundly influenced by clinical case presentations for providing evidence-based medicine. However, concerns about weak inferences and the high likelihood of bias associated with such reports have resulted in minimal attention being devoted to developing frameworks for approaching, appraising, synthesizing, and applying evidence derived from case reports/series. Nevertheless, the nature of being in a connected world through the emerging information technologies presented a wind of change to link these clinical cases to create together with other knowledge sources from basic science to enhance human health and well-being as well as to build stronger evidence-based medicine. This article is an attempt to describe how to link clinical cases described through the SOAP (Subjective, Objective, Assessment, and Plan) note to the electronic healthcare record and the other associated clinical information from diverse courses. It is part of our efforts to extend our developed QL4POMR problem-oriented medical record to provide more associated clinical information on related drugs and evidence that strengthen the clinician's decision for diagnosis and prognosis. Providing such clinical association was made through the incorporation of a data layer using the Gatsby API and the external biomedical associations through the OpenTargets API.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,717
Score d'incertitude au seuil0,199

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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