Krebs von den lungen-6 as a clinical marker for hypersensitivity pneumonitis: A meta-analysis and bioinformatics analysis
Notice bibliographique
Résumé
Aim: Hypersensitivity pneumonitis (HP), also referred to as exogenous allergic alveolitis, is one of the most common interstitial lung diseases (ILDs). A potential immune biomarker, Krebs von den lgen-6 (KL-6) characterizes the progression and severity of HP. The meta-analysis in this study was conducted to elucidate the variations in the concentrations of KL-6 in different types of HP. Methods: A systematic search of various databases such as EMBASE, Pubmed, CNKI, VIP, Web of Science, and WanFang was carried out to find relevant published articles between January 1980 and August 2022 that explored the relationship between KL-6 and allergic pneumonia. Standardized mean difference (SMD) and 95% confidence interval (CI) were used as effect sizes for comparison among different groups. The GSE47460 and GSE150910 datasets were downloaded to extract and validate the differences in KL-6 mRNA expression between HP lung tissue and healthy controls. Furthermore, the single-cell sequencing dataset GSE135893 was downloaded to extract KL-6 mRNA expression in type II alveolar epithelial cells to validate the differences between HP and healthy controls. Two researchers evaluated the quality of the included studies by employing Newcastle-Ottawa Scale. All the qualified studies were subjected to statistical analyses carried out utilizing RevMan 5.2, Stata 11.0, and R software 4.1.3. Results: Twenty studies aligned perfectly with the inclusion criteria of the meta. The concentrations of KL-6 were substantially higher in the blood of HP patients as compared to the control group. Subgroup analyses were carried out in accordance with the allergen source and the results revealed that patients with different allergens had higher blood KL-6 concentrations than healthy controls. Additionally, different subgroups of subjects were created for meta-analysis as per the fibrosis status, race, measurement method, and sample type. The concentration of KL-6 in blood was much higher in all HP subgroups than in healthy control groups. Moreover, the bioinformatics analysis revealed that KL-6 mRNA expression was higher in HP lung tissue and type II alveolar epithelial cells as compared to healthy controls. Conclusion: The present meta-analysis and bioinformatics analysis suggested that the concentration levels of KL-6 varied between HP patients and healthy individuals, and the KL-6 concentrations may be higher in the blood samples of HP patients. Systematic review registration: https://www.crd.york.ac.uk/prospero/, CRD42022355334.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,017 | 0,032 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,014 | 0,060 |
| Bibliométrie | 0,009 | 0,013 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».