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Enregistrement W4311119859 · doi:10.1038/s41467-022-35146-z

N6-methyladenosine RNA modification regulates photosynthesis during photodamage in plants

2022· article· en· W4311119859 sur OpenAlexaff
Man Zhang, Yunping Zeng, Rong Peng, Jie Dong, Ye-Lin Lan, Sujuan Duan, Zhenyi Chang, Jian Ren, Guan‐Zheng Luo, Bing Liu, Kamil Růžička, Kewei Zhao, Hongbin Wang, Hong‐Lei Jin

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesGuangdong Special Support PlanNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPhotosynthesisPhotoprotectionTranslation (biology)Photosystem IIArabidopsisBiologyCell biologyRNAPhotosystem IBiophysicsGeneChemistryMutantBotanyMessenger RNABiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract N 6 -methyladenosine (m 6 A) modification of mRNAs affects many biological processes. However, the function of m 6 A in plant photosynthesis remains unknown. Here, we demonstrate that m 6 A modification is crucial for photosynthesis during photodamage caused by high light stress in plants. The m 6 A modification levels of numerous photosynthesis-related transcripts are changed after high light stress. We determine that the Arabidopsis m 6 A writer VIRILIZER (VIR) positively regulates photosynthesis, as its genetic inactivation drastically lowers photosynthetic activity and photosystem protein abundance under high light conditions. The m 6 A levels of numerous photosynthesis-related transcripts decrease in vir mutants, extensively reducing their transcript and translation levels, as revealed by multi-omics analyses. We demonstrate that VIR associates with the transcripts of genes encoding proteins with functions related to photoprotection (such as HHL1 , MPH1 , and STN8 ) and their regulatory proteins (such as regulators of transcript stability and translation), promoting their m 6 A modification and maintaining their stability and translation efficiency. This study thus reveals an important mechanism for m 6 A-dependent maintenance of photosynthetic efficiency in plants under high light stress conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,289
Score d'incertitude au seuil0,552

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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