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Enregistrement W4311404537 · doi:10.1093/rheumatology/keac698

Serum IFNα2 levels are associated with disease activity and outperform IFN-I gene signature in a longitudinal childhood-onset SLE cohort

2022· article· en· W4311404537 sur OpenAlexfundno aff
M. J. Wahadat, Hongchao Qi, Cornelia G van Helden-Meeuwsen, Erika Huijser, Lotte van den Berg, Annette van Dijk-Hummelman, Jens Göpfert, Anne Heine, Marleen Verkaaik, Marco W.J. Schreurs, Willem A. Dik, Sylvia Kamphuis, Marjan A. Versnel

Notice bibliographique

RevueLara D. Veeken · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Lupus Erythematosus Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesArthritis SocietyDutch Arthritis Society
Mots-clésMedicineInternal medicineCohortSystemic lupus erythematosusGastroenterologyImmunologyLupus erythematosusDiseaseAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To study the association of serum IFNα2 levels measured by ultrasensitive single-molecule array (Simoa) and the IFN-I gene signature (IGS) with disease activity and determine whether these assays can mark disease activity states in a longitudinal cohort of childhood-onset SLE (cSLE) patients. METHODS: Serum IFNα2 levels were measured in 338 samples from 48 cSLE patients and 67 healthy controls using an IFNα Simoa assay. Five-gene IGS was measured by RT-PCR in paired whole blood samples. Disease activity was measured by clinical SELENA-SLEDAI and BILAG-2004. Low disease activity was defined by Low Lupus Disease Activity State (LLDAS) and flares were characterized by SELENA-SLEDAI flare index. Analysis was performed using linear mixed models. RESULTS: A clear positive correlation was present between serum IFNα2 levels and the IGS (r = 0.78, P < 0.0001). Serum IFNα2 levels and IGS showed the same significant negative trend in the first 3 years after diagnosis. In this timeframe, mean baseline serum IFNα2 levels decreased by 55.1% (Δ 201 fg/ml, P < 0.001) to a mean value of 164 fg/ml, which was below the calculated threshold of 219.4 fg/ml that discriminated between patients and healthy controls. In the linear mixed model, serum IFNα2 levels were significantly associated with both cSELENA-SLEDAI and BILAG-2004, while the IGS did not show this association. Both IFN-I assays were able to characterize LLDAS and disease flare in receiver operating characteristic analysis. CONCLUSIONS: Serum IFNα2 levels measured by Simoa technology are associated with disease activity scores and characterize disease activity states in cSLE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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