MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4311417596 · doi:10.1097/mao.0000000000003756

Myosin Mutations and Sudden Sensorineural Hearing Loss: Results of Whole Exome Sequencing

2022· article· en· W4311417596 sur OpenAlexaff
Rahul K. Sharma, Madeleine A. Drusin, Joseph Hostyk, Evan H. Baugh, Vimla S. Aggarwal, David B. Goldstein, Ana H. Kim

Notice bibliographique

RevueOtology & Neurotology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHearing, Cochlea, Tinnitus, Genetics
Établissements canadiensColumbia College
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineExome sequencingSensorineural hearing lossAudiologyHearing lossGeneticsMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Idiopathic sudden sensorineural hearing loss (ISSNHL) affects 66,000 patients per year in the United States. Genetic mutations have been associated with progressive hearing loss; however, genetic mutations associated with ISSNHL have not been identified. METHODS: A prospective cohort study of adults older than 18 years presenting with ISSNHL at a tertiary academic medical center. Whole exome sequencing (WES) was conducted using Genome Analysis Toolkit best practices. An automated diagnostic screen employing a variety of models for pathogenicity was conducted across all genes with no specific targets. Candidate pathogenic variants were reviewed by a team of geneticists and clinicians. Variants were crossed-referenced with 92 known hearing loss associated genes. RESULTS: Twenty-nine patients with SSNHL were screened using WES. The average age of patients was 53 ± 17.1 years, and most patients were White (62%) and men (55%). The mean pure tone average was 64.8 ± 31.3 dB for the affected ear. Using a 0.1% allele frequency screen, 12 (41%) cases had a mutation in any of the nine selected myosin genes. When we restrict to singletons (allele frequency = 0%), 21% (n = 6) of cases have qualifying variants, whereas only 3.8% (n = 481) of 12,577 healthy controls carry qualifying variants (p < 0.01). Most mutations (80%) were missense mutations. Of the novel mutations, one was a frameshift mutation, and two were a stop-gained function. Three were missense mutations. CONCLUSION: Myosin mutations may be associated with ISSNHL. However, larger population screening is needed to confirm the association of myosin mutation with ISSNHL and steroid responsiveness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueOtology & NeurotologyMême sujetHearing, Cochlea, Tinnitus, GeneticsTravaux en français237 207