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Enregistrement W4311448329 · doi:10.1056/nejmoa2207406

Deep Intronic <i>FGF14</i> GAA Repeat Expansion in Late-Onset Cerebellar Ataxia

2022· article· en· W4311448329 sur OpenAlexafffundabout
David Pellerin, Matt C. Danzi, Carlo Wilke, M. Renaud, Sarah Fazal, Marie‐Josée Dicaire, Carolin K. Scriba, Catherine Ashton, Christopher Yanick, Danique Beijer, Adriana Rebelo, Clarissa Rocca, Zane Jaunmuktane, Joshua A. Sonnen, Roxanne Larivière, David Genı́s, Laura Molina‐Porcel, Karine Choquet, Rawan Sakalla, Sylvie Provost, Rebecca Robertson, Xavier Allard‐Chamard, Martine Tétreault, Sarah J. Reiling, Sara Nagy, Vikas Nishadham, Meera Purushottam, Seena Vengalil, Mainak Bardhan, Atchayaram Nalini, Zhongbo Chen, Jean Mathieu, Rami Massie, Colin Chalk, Anne‐Louise Lafontaine, François Evoy, Marie‐France Rioux, Jiannis Ragoussis, Kym M. Boycott, Marie‐Pierre Dubé, Antoine Duquette, Henry Houlden, Gianina Ravenscroft, Nigel G. Laing, Phillipa J. Lamont, Mario Saporta, Rebecca Schüle, Lüdger Schöls, Roberta La Piana, Matthis Synofzik, Stephan Züchner, Bernard Brais

Notice bibliographique

RevueNew England Journal of Medicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensUniversity of OttawaUniversité de SherbrookeMcGill Genome CentreUniversité de MontréalChildren's Hospital of Eastern OntarioCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and HospitalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesFondation Groupe MonacoNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilMedizinischen Fakultät, Eberhard Karls Universität TübingenLeonard M. Miller School of MedicineNational Institutes of HealthFondation de l'Hôpital Général de MontréalUniversitat de BarcelonaElse Kröner-Fresenius-StiftungUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustEberhard Karls Universität TübingenInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleEuropean CommissionNational Institute of Mental Health and NeurosciencesWellcome TrustUniversity College LondonCanadian Institutes of Health ResearchRoyal College of Physicians and Surgeons of CanadaMcGill UniversityDeutsche ForschungsgemeinschaftGenome CanadaBrain Research UKBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute for Health and Care ResearchChildren's Hospital of Eastern Ontario FoundationOntario GenomicsCanada Foundation for InnovationDeutsches Zentrum für Neurodegenerative ErkrankungenOntario Genomics InstituteGénome QuébecNational Institute of Mental HealthUniversität BaselAustralian GovernmentFondation du Grand défi Pierre LavoieUniversité de LorraineUniversity of Miami
Mots-clésTrinucleotide repeat expansionOdds ratioAtaxiaBiologyInternal medicineGeneticsMedicineNeuroscienceGeneAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The late-onset cerebellar ataxias (LOCAs) have largely resisted molecular diagnosis. METHODS: We sequenced the genomes of six persons with autosomal dominant LOCA who were members of three French Canadian families and identified a candidate pathogenic repeat expansion. We then tested for association between the repeat expansion and disease in two independent case-control series - one French Canadian (66 patients and 209 controls) and the other German (228 patients and 199 controls). We also genotyped the repeat in 20 Australian and 31 Indian index patients. We assayed gene and protein expression in two postmortem cerebellum specimens and two induced pluripotent stem-cell (iPSC)-derived motor-neuron cell lines. RESULTS: RNA and protein. CONCLUSIONS: was found to be associated with LOCA. (Funded by Fondation Groupe Monaco and others.).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,122
Score d'incertitude au seuil0,243

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations243
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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