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Enregistrement W4311449897 · doi:10.36939/ir.202212141546

It's JustiFlied: The Endogenous Retrovirus K Integrase Induces Motor Disturbances in Transgenic Drosophila

2022· dissertation· en· W4311449897 sur OpenAlexafffund
Ilena Benoit

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of Winnipeg
Organismes subventionnairesUniversity of Winnipeg
Mots-clésAmyotrophic lateral sclerosisBiologyIntegraseNeurodegenerationDNA damageGenome instabilityNeuropathologyGeneticsRetrovirusTransgeneMotor neuronGeneNeuroscienceDNADiseaseMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) is an incurable neurodegenerative disease characterized by the loss of cortical and spinal motor neurons. Endogenous retrovirus K (ERVK) is a genomic viral symbiont that has been associated with motor neuron loss in ALS. The ERVK integrase (IN) is an enzyme with a role in driving neuropathology and motor deficit. The primary role of the viral IN enzyme is to insert viral DNA into the host cell genome. Accumulating evidence also points to ERVK IN activity causing DNA damage and genomic instability in the host. In Drosophila, retroelement activity contributes to deregulation of the ALS risk gene TARDBP (TDP-43, TBPH in Drosophila) via DNA damage-mediated cell toxicity. This suggests a dynamic interaction between TDP-43 biology, DNA damage and retroelements. I have determined that motor disability in ERVK IN expressing Drosophila correlates with neuropathological evidence of DNA damage, inflammation, and TDP-43 aggregation. Viability and behavioral assays and the Trikinetics DAM5H monitor were used to assess motor impairment in ERVK IN expressing flies. Two FDA approved HIV integrase inhibitors were administered to determine if the progression of motor impairments could be limited. Western blot analysis was used to monitor changes in ERVK IN, ãH2AV (DNA damage marker), TDP-43, PARP1 and other related proteins over time. Pathological molecular markers were correlated with behavioural assays for motor function, to identify potential biomarkers. Establishment of this model allowed me to assess the association between ERVK IN-driven motor impairment and neuropathological outcomes. Determining the effect of integrase inhibitors in ERVK IN expressing Drosophila is a crucial step towards evaluating antivirals as a novel therapeutic strategy for the reversal of motor neuron damage and motor deficit in ALS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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Résumé présentoui

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