SDC4: A Target Enabling Package
Notice bibliographique
Résumé
Syndecan-4 (SDC4) is a member of a family of syndecan transmembrane receptors, which interact with a variety of extracellular targets. Syndecan signalling leads to endocytosis, endosomal sorting, and exosome export of bound ligands, a process which is dependent on the binding of syndecan-binding protein (SDCBP) to the intracellular tails of syndecans. Cellular trafficking of Aβ is dependent on syndecan/SDCBP activity (2). SDC4 was found within a TMT proteomics network module (Module 42) that contains mostly novel but also well-known AD targets, whose levels are elevated in AD patient brains (1). Inhibition of SDC4 signalling is predicted to reduce the Aβ burden in AD patient brains (3). The aim of this TEP is to generate reagents useful for investigating the role of SDC4 in Alzheimer’s disease, such as a list of validated antibodies, generic knockout/knockdown cell lines and purified protein. Two therapeutic strategies for inhibition of SDC4 will be investigated in this TEP: 1. inhibition of SDC4 activity with an antibody and 2. inhibition of interaction of SDC4 C-terminal tail with SDCBP with small molecules.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,312 | 0,224 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».