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Enregistrement W4311616651 · doi:10.14740/cr1449

Overlapping Phenotype of Adult-Onset <i>ALPK3</i>-Cardiomyopathy in the Setting of Two Novel Variants

2022· article· en· W4311616651 sur OpenAlexvenueno aff
О. С. Чумакова, Natalia V. Milovanova, Igor Bychkov, Ekaterina Zakharova, Е. А. Мершина, V. Е. Sinitsin, D. A. Zateyshchikov

Notice bibliographique

RevueCardiology Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCardiologyInternal medicineCardiomyopathyPhenotypeHeart failureGeneticsGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inherited cardiomyopathies (CMPs) are fairly common causes of morbidity and mortality, particularly, in young individuals. In substantial number of cases, only morphological diagnostic criteria cannot distinguish one CMP from another because of incomplete penetrance, advanced stage of the disease, or overlapping phenotypes. Genetic testing has become a mandatory tool for definite diagnosis that is required for family screening, individual prognosis, and personalized treatment strategy in routine practice. In parallel, accumulation of genotype-phenotype correlations, especially for rare genes, promotes the deciphering of underling molecular mechanisms and the development of targeting treatment of CMPs. Here we present an adult-onset case comprised morphological features of several CMPs: asymmetric left ventricle (LV) hypertrophy, severe systolic dysfunction, LV hypertrabeculation and restrictive physiology. Using next-generation sequencing, two novel variants (NM_020778.5:c.1958C&gt;G:p.Ser653* and c.3491G&gt;A:p.Arg1164Gln) in alpha-protein kinase 3 ( ALPK3 ) gene were identified and confirmed with Sanger sequencing. The trans-position (location on different alleles) of identified ALPK3 variants was established by plasmid cloning method. The ALPK3 gene, encoding nuclear alpha-protein kinase 3, has only recently been associated with CMPs and there are still few clinical data on ALPK3 variant carriers. To date, only five affected individuals with adult-onset CMPs in the setting of biallelic variants of ALPK3 gene have been reported. Cardiol Res. 2022;13(6):398-404 doi: https://doi.org/10.14740/cr1449

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,113
Score d'incertitude au seuil0,487

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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