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Enregistrement W4311633418 · doi:10.4081/jlimnol.2022.2095

Exploring diatom diversity through cultures - a case study from the Bow River, Canada

2022· article· en· W4311633418 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueJournal of Limnology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueDiatoms and Algae Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBundesministerium für Bildung und ForschungFreie Universität BerlinGovernment of Alberta
Mots-clésDiatomTaxonBenthic zoneBiologyEcologyTaxonomy (biology)BiodiversityIdentification (biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diatom cultures can help answer taxonomic, biogeographic and ecological questions on a local and global scale. Unialgal cultures are derived from a single cell and provide abundant material for morphological and molecular analyses. The link between the historic morphological species concept and the molecular data is becoming increasingly important with the use of eDNA metabarcoding. Additionally, cultures provide insights into the life cycle of diatoms and thereby complement taxonomy and species ecology. In this study, we present an approach to extract benthic diatoms from an environmental sample to generate unialgal cultures. We explored diatom diversity in preserved assemblages and by culturing as many different taxa as possible from benthic freshwater samples taken on the same day from the Bow River in Calgary, Canada. With both methods we found a total of 221 different benthic diatom taxa, of which 182 were identified in the preserved diatom assemblages. Interestingly, an additional 39 taxa only appeared in the cultures. In total 129 strains were cultivated representing 71 different taxa. This study includes pictures of living cells demonstrating the additional merits of unialgal cultures, as they provide information on plastid details, auxospores and endosymbionts. Both, the identification of the diatom assemblages and the generation and identification of strains provide the foundation for additional water quality assessment tools, taxonomic insights and molecular references libraries.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,498
Score d'incertitude au seuil0,763

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,124
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle