Real-time PCR and immunocytochemical study of chondroitin sulfate proteoglycans after scratch wounding in cultured astrocytes
Notice bibliographique
Résumé
Background: Various in vivo and in vitro models have been described in order to elucidate the pathobiology underlying the traumatic brain injury (TBI) and test potentially suitable treatments. Since TBI is a complex disease, models differ in regard to the aspect of TBI that is being investigated. One of the used in vitro models is the scratch wound assay, first established as a reproducible, low-cost assay for the analysis of cell migration in vitro. The aim of the present study was to further investigate the relevancy of this model as a counterpart of in vivo TBI models. Methods: We have examined the astrocytic response to a mechanical injury in terms of expression of chondroitin sulfate proteoglycans (CSPGs) - phosphacan, neurocan and brevican, using real-time PCR and immunocytochemistry. Results: Our results indicate that in vitro scratch wounding alters the expression profile of examined CSPGs. Four hours after the scratch injury of the astrocytic monolayer, real-time PCR analysis revealed upregulation of mRNA levels for phosphacan (3-fold) and neurocan (2-fold), whereas brevican mRNA was downregulated (2-fold). Immunofluorescent signal for phosphacan and neurocan was more intense in astrocytes close to the injury site, while brevican was scarcely present in cultured astrocytes. Conclusions: Obtained results indicate that CSPGs are differentially expressed by astrocytes after scratch wounding, demonstrating that the scratch wound model might be suitable for investigation of astrocyte-derived response to injury.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».