Complex Yet Coordinated: Regulation of Transcriptional Factors and Cell Signaling Pathways to Endure Anoxia in Rana sylvatica
Notice bibliographique
Résumé
Wood frogs (Rana sylvatica) are a well-studied vertebrate model of natural freeze tolerance, surviving several months of winter subzero temperatures with 65-70% of total body water frozen as extracellular ice.Freezing halts blood circulation, heartbeat and breathing, restricting oxygen availability throughout the body and requiring a switch to anaerobic glycolysis for energy production, with its much lower ATP yield.To survive, wood frogs suppress their metabolic rate by about 90% to match ATP availability from glycolysis alone.Multiple cellular processes are regulated and suppressed, sustaining only pro-survival pathways until thawing occurs.Episodes of anoxia/reoxygenation also elevate reactive oxygen species (ROS) production that can surpass the antioxidant capacity of cells causing oxidative stress and tissue damage.This thesis examined a network of stressresponsive transcription factors (NRF2, OCT1, OCT4, YAP/TEAD, and RBPJ) and their associated pathways to determine their response and regulation over the anoxia/reoxygenation cycle.Decreased binding of transcriptional complexes to the promoter regions of target genes indicated a global reduction in transcription/translation processes.The data show also "functional switching" of OCT1, OCT4, and MAML while selectively upregulating antioxidants in a stress/organ specific manner.The present studies also shed new light on tissue repair mechanisms by demonstrating upregulation of selected pathway proteins.An increase in AHCY levels in liver also suggests maintenance of redox control, and elevated JMJD2C, TAZ, and MAML in skeletal and cardiac muscles indicates a potential increase in the expression of MyoD for muscle regeneration.Overall, the findings of this thesis document a complex yet coordinated network of transcriptional iii factors that support metabolic rate depression during freezing, combat oxidative stress, and initiate tissue repair mechanisms to endure prolonged anoxia and maintain cellular homeostasis in frozen wood frogs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».