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Enregistrement W4311681150 · doi:10.22215/etd/2022-15199

Role of Glucose-induced Transcription Factor Signalling and Mitochondrial Epigenetics in Stress Tolerant Wood Frog, Rana sylvatica

2022· dissertation· en· W4311681150 sur OpenAlexafffund
Gurjit Singh

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyTXNIPTranscription factorCell biologyGlucose homeostasisWRKY protein domainInternal medicineEndocrinologyTranscriptomeGeneBiochemistryOxidative stressGene expressionThioredoxinDiabetes mellitus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The freeze-tolerant wood frogs, Rana sylvatica are one of only a few vertebrate species in the animal kingdom which are extensively studied to understand vertebrate freeze tolerance.They undergo whole-body freezing during winter and become ice solid with no heartbeat, brain activity and blood flow but amazingly come back to life during spring, unharmed without any major changes in their body.Freeze survival is challenging, with wood frogs facing ischemia due to freezing of blood, dehydration via cell volume reductions due to loss of 60-70% of total body water into extracellular space as well as hyperglycemia, producing a large amount of glucose as a cryoprotectant.Interestingly, wood frogs can also tolerate these stresses independent of freezing.Also, winter survival by wood frogs is associated with a metabolic reorganization to reduce their energy demands to a bare minimum by globally suppressing energy-expensive pathways and selectively regulating genes to prioritize available energy use for pro-survival pathways.This thesis examined the effects of freezing and dehydration-induced hyperglycemic response in selectively inducing transcription factor MondoA in regulating glucose-induced transcription and activating an adaptive transcriptional response to induce stress response via inflammasome activation, mitochondrial dysfunction and mitochondrial epigenetics.The current findings establish MondoA in guiding an adaptive transcriptional response to activate genes regulating glucose homeostasis and circadian rhythm in a tissue-specific manner in the liver during the freeze/thaw cycle.Also, the role of TXNIP (downstream to MondoA) and its PTMs, in activating inflammasome via NLRP-3 in a stress-specific way iv during freezing was shown.Moreover, the higher mitochondrial presence of TXNIP did not correlate to protein expression of its downstream targets in inducing mitochondrial dysfunction in any of the stresses, which were attributed to its low/weak binding to TRX-2.Investigating the role of mitochondrial methylation suggests its tissue-specific regulation in the liver and potential role in maintaining a tight regulation of mitochondrial transcriptional and gene expression response.Altogether, findings from this thesis demonstrate that a highly synchronized and intricate control via multiple levels of regulation is present in activating mechanisms that are involved in maintaining cellular milieu during stress in wood frogs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
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