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Enregistrement W4311791768 · doi:10.3390/app122412862

Bacterial Communities in Informal Dump Sites: A Rich Source of Unique Diversity and Functional Potential for Bioremediation Applications

2022· article· en· W4311791768 sur OpenAlexaff
Ramganesh Selvarajan, Henry Joseph Oduor Ogola, Chimdi Mang Kalu, Timothy Sibanda, Chinedu Obize

Notice bibliographique

RevueApplied Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAcidobacteriaGemmatimonadetesProteobacteriaFirmicutesChloroflexi (class)ActinobacteriaBiologyBacteroidetesBioremediationEcologyBacteria16S ribosomal RNAContamination

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this study, high-throughput metagenomic amplicon sequencing and physicochemical analyses were used to evaluate the structural composition and functional diversity of the soil bacterial communities at different illegal waste dump sites. Results showed that while the litter-free soil was dominated by the phylum Proteobacteria, dumpsite soils were enriched with phylum Actinobacteria, followed by Proteobacteria, Firmicutes, Chloroflexi, Acidobacteria, Planctomycetes, Bacteroidetes, and Gemmatimonadetes. Bacterial diversity differed significantly (p > 0.05) between the litter-free and contaminated sites, with each dumpsite having distinct genera that demonstrate the impact of waste type on the bacterial community composition. Genus Nocardioides, a versatile organic and inorganic pollutant-degrading bacteria in the class Actinomycetia, was dominant in the dump site soils, raising the possibility that this genus could serve as a potential biomarker for dump site soil pollution. PICRUSt functional profiling also showed the presence of genes involved in putative degradative pathways in the dump site soils. Furthermore, community-level physiological profile (CLPP) analyses revealed that the dump site soils are habitats to active bacterial communities with significant catabolic and carbon utilization capacity. Overall, this study provides a theoretical insight into the diversity and unique soil bacterial assemblages in illegal dump sites that could encode biotechnologically significant genes for biosynthesis and biodegradation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,485
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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