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Enregistrement W4311820929 · doi:10.1038/s42003-022-04306-8

CryoEM structures of anion exchanger 1 capture multiple states of inward- and outward-facing conformations

2022· article· en· W4311820929 sur OpenAlex
Hristina R. Zhekova, Jiansen Jiang, Weiguang Wang, Kirill Tsirulnikov, Gülru Kayık, Hanif M. Khan, Rustam Azimov, Natalia Abuladze, Liyo Kao, Debbie Newman, Sergei Y. Noskov, D. Peter Tieleman, Z. Hong Zhou, Alexander Pushkin, Ira Kurtz

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCalifornia NanoSystems InstituteNational Center for Research ResourcesDivision of Materials ResearchNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Science FoundationCompute CanadaCanadian Institutes of Health ResearchU.S. Department of Health and Human ServicesNational Institutes of HealthCanada Research ChairsUniversity of California, Los AngelesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesUniversity of Calgary
Mots-clésBand 3ChemistryBiophysicsTransmembrane domainElongationProtein structureMutagenesisCrystallographyTransporterAmino acidMembraneBiochemistryMembrane proteinMutationBiologyMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anion exchanger 1 (AE1, band 3) is a major membrane protein of red blood cells and plays a key role in acid-base homeostasis, urine acidification, red blood cell shape regulation, and removal of carbon dioxide during respiration. Though structures of the transmembrane domain (TMD) of three SLC4 transporters, including AE1, have been resolved previously in their outward-facing (OF) state, no mammalian SLC4 structure has been reported in the inward-facing (IF) conformation. Here we present the cryoEM structures of full-length bovine AE1 with its TMD captured in both IF and OF conformations. Remarkably, both IF-IF homodimers and IF-OF heterodimers were detected. The IF structures feature downward movement in the core domain with significant unexpected elongation of TM11. Molecular modeling and structure guided mutagenesis confirmed the functional significance of residues involved in TM11 elongation. Our data provide direct evidence for an elevator-like mechanism of ion transport by an SLC4 family member.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,513
Score d'incertitude au seuil0,263

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle