An RNA Paranemic Crossover Triangle as A 3D Module for Cotranscriptional Nanoassembly
Notice bibliographique
Résumé
RNA nanotechnology takes advantage of structural modularity to build self-assembling nano-architectures with applications in medicine and synthetic biology. The use of paranemic motifs, that form without unfolding existing secondary structure, allows for the creation of RNA nanostructures that are compatible with cotranscriptional folding in vitro and in vivo. In previous work, kissing-loop (KL) motifs have been widely used to design RNA nanostructures that fold cotranscriptionally. However, the paranemic crossover (PX) motif has not yet been explored for cotranscriptional RNA origami architectures and information about the structural geometry of the motif is unknown. Here, a six base pair-wide paranemic RNA interaction that arranges double helices in a perpendicular manner is introduced, allowing for the generation of a new and versatile building block: the paranemic-crossover triangle (PXT). The PXT is self-assembled by cotranscriptional folding and characterized by cryogenic electron microscopy, revealing for the first time an RNA PX interaction in high structural detail. The PXT is used as a building block for the construction of multimers that form filaments and rings and a duplicated PXT motif is used as a building block to self-assemble cubic structures, demonstrating the PXT as a rigid self-folding domain for the development of wireframe RNA origami architectures.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».