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Enregistrement W4311911909 · doi:10.1371/journal.ppat.1011041

Nsp1 proteins of human coronaviruses HCoV-OC43 and SARS-CoV2 inhibit stress granule formation

2022· article· en· W4311911909 sur OpenAlexafffund
Stacia M. Dolliver, Mariel Kleer, Maxwell P. Bui-Marinos, Ying Shan, Jennifer A. Corcoran, Denys A. Khaperskyy

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensUniversity of CalgaryDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCumming School of Medicine, University of CalgaryResearch Nova ScotiaDalhousie UniversityUniversity of TorontoMcMaster UniversityUniversity of Wisconsin-Madison
Mots-clésStress granuleCoronavirusBiologyViral replicationVirologyCell biologyViral structural proteinVirusMessenger RNAViral entryGeneTranslation (biology)GeneticsCoronavirus disease 2019 (COVID-19)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stress granules (SGs) are cytoplasmic condensates that often form as part of the cellular antiviral response. Despite the growing interest in understanding the interplay between SGs and other biological condensates and viral replication, the role of SG formation during coronavirus infection remains poorly understood. Several proteins from different coronaviruses have been shown to suppress SG formation upon overexpression, but there are only a handful of studies analyzing SG formation in coronavirus-infected cells. To better understand SG inhibition by coronaviruses, we analyzed SG formation during infection with the human common cold coronavirus OC43 (HCoV-OC43) and the pandemic SARS-CoV2. We did not observe SG induction in infected cells and both viruses inhibited eukaryotic translation initiation factor 2α (eIF2α) phosphorylation and SG formation induced by exogenous stress. Furthermore, in SARS-CoV2 infected cells we observed a sharp decrease in the levels of SG-nucleating protein G3BP1. Ectopic overexpression of nucleocapsid (N) and non-structural protein 1 (Nsp1) from both HCoV-OC43 and SARS-CoV2 inhibited SG formation. The Nsp1 proteins of both viruses inhibited arsenite-induced eIF2α phosphorylation, and the Nsp1 of SARS-CoV2 alone was sufficient to cause a decrease in G3BP1 levels. This phenotype was dependent on the depletion of cytoplasmic mRNA mediated by Nsp1 and associated with nuclear accumulation of the SG-nucleating protein TIAR. To test the role of G3BP1 in coronavirus replication, we infected cells overexpressing EGFP-tagged G3BP1 with HCoV-OC43 and observed a significant decrease in virus replication compared to control cells expressing EGFP. The antiviral role of G3BP1 and the existence of multiple SG suppression mechanisms that are conserved between HCoV-OC43 and SARS-CoV2 suggest that SG formation may represent an important antiviral host defense that coronaviruses target to ensure efficient replication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,574

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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