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Enregistrement W4311931477 · doi:10.1002/art.42423

Association Between <scp><i>HLA</i></scp><i>–<scp>DPB1</scp></i> and Antineutrophil Cytoplasmic Antibody–Associated Vasculitis in Children

2022· article· en· W4311931477 sur OpenAlexafffund
Kristen M. Gibson, Britt I. Drögemöller, Dirk Foell, Susanne M. Benseler, Jinko Graham, Robert E. W. Hancock, Raashid Luqmani, David A. Cabral, Kelly L. Brown, Colin J.D. Ross

Notice bibliographique

RevueArthritis & Rheumatology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVasculitis and related conditions
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityAlberta Children's HospitalBC Centre for Disease ControlBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAnti-neutrophil cytoplasmic antibodyVasculitisHuman leukocyte antigenImmunologyAntibodyCytoplasmMedicineAntigenBiologyPathologyGeneticsDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective Antineutrophil cytoplasmic antibody (ANCA)–associated vasculitis (AAV) is a rare, life‐threatening inflammation of blood vessels that can affect both adults and children. Compared to adult‐onset disease, AAV is especially rare in children, with an annual prevalence of 0.5–6.4 cases per million children. The etiology of AAV remains largely unknown, and both environmental and genetic factors are likely involved. The present study was undertaken to explore the genetic susceptibility factors recently identified in adult patients, including HLA–DP and HLA–DQ, in pediatric patients. Methods We performed a genome‐wide association study of pediatric AAV in patients of European ancestry (n = 63 AAV cases, n = 315 population‐matched controls). Results We identified a significant genetic association between pediatric AAV and the HLA–DPB1*04:01 allele (P = 1.5 × 10−8, odds ratio [OR] 3.5), with a stronger association observed in children with proteinase 3–ANCA positivity than in children with myeloperoxidase−ANCA positivity. Among the HLA alleles, the HLA–DPB1*04:01 allele was the most highly associated with AAV, although not significantly, in a follow‐up adult AAV cohort (P = 2.6 × 10−4, OR 0.4). T cell receptor and interferon signaling pathways were also shown to be enriched in the pediatric AAV cohort. Conclusion The HLA–DPB1 locus showed an association with pediatric AAV, as similarly shown previously in adult AAV. Despite the difference in the age of onset, these findings suggest that childhood‐ and adult‐onset vasculitis share a common genetic predisposition. The identification of genetic variants contributing to AAV is an important step to improved classification tools and treatment strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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