The <scp>TRAPP</scp> complexes: oligomeric exchange factors that activate the small <scp>GTPases</scp> Rab1 and Rab11
Notice bibliographique
Résumé
The Transport Protein Particle (TRAPP) complexes are highly conserved multisubunit complexes that act as nucleotide exchange factors (GEFs) for Rab GTPases. They act in both protein secretion and autophagy and have also been proposed to have a role in other processes such as cytokinesis and ciliogenesis. There are two TRAPP complexes in metazoans: TRAPPII, which activates Rab11; and TRAPPIII, which activates Rab1. Both complexes share a core of small subunits that form the active site for the exchange of GDP for GTP. In addition, each TRAPP complex has distinct large subunits that determine the specificity of each complex towards its substrate Rab and are essential for activity in vivo. Crystal structures have revealed the organisation of the TRAPP core and the mechanism of Rab1 activation, whilst recent cryo-EM structures have unveiled the arrangement of the specific subunits around the core to form each complex. Combining these findings with functional experiments has allowed the proposal of mechanisms for how the specificity of each complex towards their cognate Rab is determined and for the arrangement of these large complexes on the membrane.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».