Prevalence of bat viruses associated with land-use change in the Atlantic Forest, Brazil
Notice bibliographique
Résumé
Introduction Bats are critical to maintaining healthy ecosystems and many species are threatened primarily due to global habitat loss. Bats are also important hosts of a range of viruses, several of which have had significant impacts on global public health. The emergence of these viruses has been associated with land-use change and decreased host species richness. Yet, few studies have assessed how bat communities and the viruses they host alter with land-use change, particularly in highly biodiverse sites. Methods In this study, we investigate the effects of deforestation on bat host species richness and diversity, and viral prevalence and richness across five forested sites and three nearby deforested sites in the interior Atlantic Forest of southern Brazil. Nested-PCR and qPCR were used to amplify and detect viral genetic sequence from six viral families (corona-, adeno-, herpes-, hanta-, paramyxo-, and astro-viridae) in 944 blood, saliva and rectal samples collected from 335 bats. Results We found that deforested sites had a less diverse bat community than forested sites, but higher viral prevalence and richness after controlling for confounding factors. Viral detection was more likely in juvenile males located in deforested sites. Interestingly, we also found a significant effect of host bat species on viral prevalence indicating that viral taxa were detected more frequently in some species than others. In particular, viruses from the Coronaviridae family were detected more frequently in generalist species compared to specialist species. Discussion Our findings suggest that deforestation may drive changes in the ecosystem which reduce bat host diversity while increasing the abundance of generalist species which host a wider range of viruses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».