Three Methods Assessing the Association of the Endophytic Entomopathogenic Fungus Metarhizium robertsii with Non-Grafted Grapevine Vitis vinifera
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Characterizing the association of endophytic insect pathogenic fungi (EIPF) with plants is an important step in order to understand their ecology before using them in biological control programs. Since several methods are available, it is challenging to identify the most appropriate for such investigations. Here, we used two strains of Metarhizium robertsii: EF3.5(2) native to the French vineyard environment and ARSEF-2575-GFP a laboratory strain expressing a green fluorescent protein, to compare their potential of association with non-grafted grapevine Vitis vinifera. Three methods were used to evaluate the kinetics of rhizosphere and grapevine endospheric colonization: (i) Droplet Digital (ddPCR), a sensitive molecular method of M. robertsii DNA quantification in different plant parts, (ii) culture-based method to detect the live fungal propagules from plant tissues that grew on the medium, (iii) confocal imaging to observe roots segments. Both strains showed evidence of establishment in the rhizosphere of grapevines according to the culture-based and ddPCR methods, with a significantly higher establishment of strain EF3.5(2) (40% positive plants and quantified median of exp(4.61) c/μL) compared to strain ARSEF-2575-GFP (13% positive plants and quantified median of exp(2.25) c/μL) at 96–98 days post-inoculation. A low incidence of association of both strains in the grapevine root endosphere was found with no significant differences between strains and evaluation methods (15% positive plants inoculated with strain EF3.5(2) and 5% with strain ARSEF-2575-GFP according to culture-based method). ddPCR should be used more extensively to investigate the association between plants and EIPF but always accompanied with at least one method such as culture-based method or confocal microscopy.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle