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Enregistrement W4312032633 · doi:10.1002/csc2.20895

Mega‐environment analysis and breeding for specific adaptation

2022· article· en· W4312032633 sur OpenAlexaffabout
Weikai Yan, Kirby T. Nilsen, Aaron D. Beattie

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetics and Plant Breeding
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanBrandon UniversityAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiplotBiologyAdaptation (eye)Selection (genetic algorithm)HeritabilityMega-Gene–environment interactionCropBiotechnologyAdaptabilityPlant breedingCultivarStatisticsGenotypeAgronomyComputer scienceMathematicsEvolutionary biologyEcologyGeneticsArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mega‐environment (ME) analysis is analysis of multi‐year, multi‐location crop variety trial data conducted in a target region of a crop to understand the magnitude and nature of genotype‐by‐environment interaction (GE) of the crop in the region. If repeatable GE patterns are identified, then the target region must be divided into subregions or MEs. Breeding and utilizing ME‐specific cultivars will convert the repeatable GE into genotypic main effect (G) within ME, thereby improving heritability (selection reliability) and selection gain and maximize regional and overall productivity. If no repeatable GE is found, then the target region must be treated as a single ME and the GE must be accommodated by testing adequately, that is, at a sufficient number of locations in a sufficient number of years. This paper presents a theoretical framework of ME analysis, describes graphical tools to reveal the which‐won‐where patterns in a genotype‐by‐environment dataset, and demonstrates LG (location‐grouping) biplot analysis for revealing repeatable GE patterns and delineating MEs. The concept of G + GE or GGE, that is, GE relative to G, is emphasized. It is the relative GE that is the basis for ME analysis and breeding for specific adaptation; absolute magnitude of GE has little relevance for these purposes. Breeding ME‐specific oat cultivars in Canada is demonstrated with a real‐world example.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,152 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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