MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4312065018 · doi:10.2196/41200

Identifying Patterns of Clinical Interest in Clinicians’ Treatment Preferences: Hypothesis-free Data Science Approach to Prioritizing Prescribing Outliers for Clinical Review

2022· article· en· W4312065018 sur OpenAlexvenueno aff
Brian MacKenna, Helen J Curtis, Lisa Hopcroft, Alex J Walker, Richard Croker, Orla Macdonald, Stephen Evans, Peter Inglesby, David Evans, Jessica Morley, Seb Bacon, Ben Goldacre

Notice bibliographique

RevueJMIR Medical Informatics · 2022
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacovigilance and Adverse Drug Reactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute for Health and Care ResearchNational Institute for Health and Care Research Applied Research Collaboration Oxford and Thames ValleyResearch for Patient Benefit ProgrammeDepartment of Health and Social CareWellcome Trust
Mots-clésOutlierMedical prescriptionRanking (information retrieval)AntipsychoticMedicineSet (abstract data type)PharmacoepidemiologyData miningComputer scienceInformation retrievalPsychiatryArtificial intelligenceSchizophrenia (object-oriented programming)Pharmacology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Data analysis is used to identify signals suggestive of variation in treatment choice or clinical outcome. Analyses to date have generally focused on a hypothesis-driven approach. OBJECTIVE: This study aimed to develop a hypothesis-free approach to identify unusual prescribing behavior in primary care data. We aimed to apply this methodology to a national data set in a cross-sectional study to identify chemicals with significant variation in use across Clinical Commissioning Groups (CCGs) for further clinical review, thereby demonstrating proof of concept for prioritization approaches. METHODS: Here we report a new data-driven approach to identify unusual prescribing behaviour in primary care data. This approach first applies a set of filtering steps to identify chemicals with prescribing rate distributions likely to contain outliers, then applies two ranking approaches to identify the most extreme outliers amongst those candidates. This methodology has been applied to three months of national prescribing data (June-August 2017). RESULTS: Our methodology provides rankings for all chemicals by administrative region. We provide illustrative results for 2 antipsychotic drugs of particular clinical interest: promazine hydrochloride and pericyazine, which rank highly by outlier metrics. Specifically, our method identifies that, while promazine hydrochloride and pericyazine are barely used by most clinicians (with national prescribing rates of 11.1 and 6.2 per 1000 antipsychotic prescriptions, respectively), they make up a substantial proportion of antipsychotic prescribing in 2 small geographic regions in England during the study period (with maximum regional prescribing rates of 298.7 and 241.1 per 1000 antipsychotic prescriptions, respectively). CONCLUSIONS: Our hypothesis-free approach is able to identify candidates for audit and review in clinical practice. To illustrate this, we provide 2 examples of 2 very unusual antipsychotics used disproportionately in 2 small geographic areas of England.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,222
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,462
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,222
Score d'incertitude au seuil0,960

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2220,462
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,007
Bibliométrie0,0170,012
Études des sciences et des technologies0,0020,004
Communication savante0,0070,004
Science ouverte0,0050,004
Intégrité de la recherche0,0040,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,731
Tête enseignante GPT0,600
Écart entre enseignants0,130 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJMIR Medical InformaticsMême sujetPharmacovigilance and Adverse Drug ReactionsTravaux en français237 207