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Enregistrement W4312066358 · doi:10.1002/etc.5547

1H-Nuclear Magnetic Resonance Metabolomics Analysis of <i>Arabidopsis thaliana</i> Exposed to Perfluorooctanoic Acid and Perfluoroctanesulfonic Acid

2022· article· en· W4312066358 sur OpenAlexafffund
Liam O’Hara, James G. Longstaffe

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Toxicology and Chemistry · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePer- and polyfluoroalkyl substances research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPerfluorooctanoic acidMetabolomicsEnvironmental chemistryChemistryMetaboliteBiomagnificationBiochemistryBioaccumulationChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Perfluorinated alkyl substances (PFAS) are ubiquitous environmental contaminants that are widely used in consumer products and fire suppression foams. The presence of PFAS in ground and surface water can create a route for PFAS to enter the soil, exposing ecosystems (including agroecosystems), where they will move through the food web via biomagnification. The toxicity of PFAS to plants, particularly in agricultural ecosystems, is of emerging concern due to the application of biosolids that are often contaminated with PFAS. Nevertheless, due to the low concentrations of PFAS in most agricultural soils, the direct impact of PFAS on plant health is not well understood. We used 1H-nuclear magnetic resonance (NMR) metabolomics to explore the effects of exposure of two key PFAS, perfluorooctanoic acid and perfluorooctanesulfonic acid, on Arabidopsis thaliana, a model organism. We found that Arabidopsis exhibited an accumulation of multiple metabolites, including soluble sugars (glucose and sucrose), multiple amino acids, and tri-carboxylic acid (TCA) cycle intermediates, suggesting that PFAS exposure impacts the metabolism of plants by causing an accumulation of stress-related amino acids and soluble sugars that drives increased activity of the TCA cycle. The present study shows that 1H-NMR metabolomics is a viable tool for investigating changes in the metabolic profile of plants exposed to PFAS and can be used to illuminate the stress response of plants in a high-throughput, nonbiased manner. Environ Toxicol Chem 2023;42:663–672. © 2022 SETAC

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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