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Enregistrement W4312069914 · doi:10.26434/chemrxiv-2022-05jcz

Discovery of a Potent and Selective Naphthyridine-based Chemical Probe for Casein Kinase 2

2022· preprint· en· W4312069914 sur OpenAlexfundno aff
Zachary W. Davis‐Gilbert, Andreas Krämer, James E. Dunford, Stefanie Howell, Filiz Senbabaoglu, Carrow I. Wells, Tammy M. Havener, Jeffery L. Smith, Mohammad Anwar Hossain, Udo Oppermann, David H. Drewry, Alison D. Axtman

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Structural Characterization
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEshelman Institute for Innovation, University of North Carolina at Chapel HillCanada Foundation for InnovationOntario Genomics InstituteGenome CanadaInnovative Medicines InitiativeNorth Carolina Biotechnology Center
Mots-clésCasein kinase 2KinomeChemical biologyChemistrySelectivitySmall moleculeKinaseDrug discoveryCombinatorial chemistryCasein kinase 1BiochemistryComputational biologyProtein kinase ABiologyCyclin-dependent kinase 2

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Naphthyridine-based inhibitors were synthesized to yield a potent and cell-active inhibitor of casein kinase 2 (CK2). Compound 2 selectively inhibits CK2⍺ and CK2⍺’ when profiled broadly, making it an exquisitely selective chemical probe for CK2. A negative control that is structurally related but lacks a key hinge-binding nitrogen (7) was designed based on structural studies. Compound 7 does not bind CK2⍺ or CK2⍺’ in cells and demonstrates excellent kinome-wide selectivity. Differential anti-cancer activity was observed when compound 2 was profiled alongside a structurally distinct CK2 chemical probe: SGC-CK2-1. This naphthyridine-based chemical probe (2) represents one of the best available small molecule tools to interrogate biology mediated by CK2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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