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Enregistrement W4312070437 · doi:10.3390/ijms24010081

Association between Downstream Taste Signaling Genes, Oral Microbiome, and Severe Early Childhood Caries

2022· article· en· W4312070437 sur OpenAlexafffund
Vivianne Cruz de Jesus, Betty-Anne Mittermuller, Pingzhao Hu, Robert J. Schroth, Prashen Chelikani

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueBiochemical Analysis and Sensing Techniques
Établissements canadiensWestern UniversityUniversity of ManitobaChildren's Hospital Research Institute of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMicrobiomeTasteOral MicrobiomeGeneDownstream (manufacturing)BiologyGeneticsMedicineComputational biologyBioinformaticsFood science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polymorphisms in taste receptor genes have been shown to play a role in early childhood caries (ECC), a multifactorial, biofilm-mediated disease. This study aimed to evaluate associations between severe-ECC (S-ECC), the oral microbiome, and variants in genes that encode components of the G protein-coupled receptor (GPCR) signaling cascade involved in taste sensation. A total of 176 children (88 caries-free; 88 with S-ECC) were recruited. Analyses of 16S and ITS1 rRNA microbial genes and seven (GNAQ, GNAS, GNAT3, GNAI2, RAC1, RALB, and PLCB2) human genes were pursued using next-generation sequencing. Regression analyses were performed to evaluate associations between genetic variants, S-ECC, and the supragingival plaque microbiome. Results suggest that PLCB2 rs2305645 (T), rs1869901 (G), and rs2305649 (G) alleles had a protective effect on S-ECC (rs2305645, odds ratio (OR) = 0.27 (95% confidence interval (CI): 0.14–0.51); rs1869901, OR = 0.34 (95% CI: 0.20–0.58); and rs2305649, OR = 0.43 (95% CI: 0.26–0.71)). Variants in GNAQ, GNAS, GNAT3, PLCB2, RALB, and RAC1 were associated with oral fungal and bacterial community composition. This study revealed that three loci at PLCB2 are significantly associated with S-ECC. Variants in multiple genes were associated with the composition of dental biofilm. These findings contribute to the current knowledge about the role of genetics in S-ECC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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