MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4312070798 · doi:10.1002/9781118960608.gbm01272.pub2

<i>Thermosipho</i>

2022· other· en· W4312070798 sur OpenAlexaff
Camilla Nesbø, Anne A. Farrell, Olga Zhaxybayeva, Stéphane L’Haridon

Notice bibliographique

RevueBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria · 2022
Typeother
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThiosulfateThermophileSulfurBiologyBacteriaGenusSpongeSalinityChemistryBotanyEcologyPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ther.mo.si'pho. Gr. fem. n. thermê , heat; L. masc. n. sipho , little pipe to suck drinks through, a tube; N.L. masc. n. Thermosipho , the hot tube, due to the sheath surrounding the bacteria. The genus Thermosipho is currently composed of eight species ( Thermosipho africanus , Thermosipho melanesiensis , Thermosipho japonicus , Thermosipho geolei , Thermosipho atlanticus , Thermosipho affectus , Thermosipho globiformans , and Thermosipho activus ). The rods are surrounded by an outer sheath‐like toga, and some rods form spheroids during growth. The spheroids may produce “immature progenies” that are too small to contain a complete genome, which need further investigation to elucidate their function. The cells are obligately anaerobic , thermophilic , with optimum growth temperature of 65–75°C, optimal pH 6.0–7.5, and optimal growth under low salinity 2.0–3.0% NaCl. Heterotrophic growth . Sulfur is reduced to H 2 S by all the species, while thiosulfate is reduced by Thermosipho africanus and Thermosipho japonicus . Molecular hydrogen inhibits growth. Two described Thermosipho spp. are capable of de novo biosynthesis of vitamin B12. Members of the phylum Thermotogota , class Thermotogae , order Thermotogales , and family Fervidobacteriaceae . Known habitats are shallow and deep‐sea hydrothermal vents and deep subsurface oil reservoirs. DNA G + C content (mol%) : 29.5–31.5 ( T m and genome analysis). Type species : Thermosipho africanus Huber et al. 1989, VL31 emend. Ravot et al. 1996. Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Thermosipho is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Thermotogati / Thermotogota / Thermotogae / Thermotogales / Fervidobacteriaceae / Thermosipho The genus Thermosipho can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Thermosipho (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Thermotogota / c__Thermotogae / o__Thermotogales / f__Fervidobacteriaceae / g__Thermosipho * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 </jat

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,191
Score d'incertitude au seuil0,922

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0790,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBergey's Manual of Systematics of Archaea and BacteriaMême sujetMicrobial Community Ecology and PhysiologyTravaux en français237 207