Redox proteomics and structural analyses provide insightful implications for additional non-catalytic thiol-disulfide motifs in PDIs
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Protein disulfide isomerases (PDIs) catalyze redox reactions that reduce, oxidize, or isomerize disulfide bonds and act as chaperones of proteins as they fold. The characteristic features of PDIs are the presence of one or more catalytic thioredoxin (TRX)-like domains harboring typical CXXC catalytic motifs responsible for redox reactions, as well as non-catalytic TRX-like domain. As increasing attention is paid to oxidative post-translational modifications of cysteines (Cys ox-PTMs) with the recognition that they control cellular signaling, strategies to identify sites of Cys ox-PTM by redox proteomics have been optimized. Exploration of an available Cys redoxome dataset supported by modeled structure provided arguments for the existence of an additional non-catalytic thiol-disulfide motif, distinct from those contained in the TRX type patterns, typical of PDIAs. Further structural analysis of PDIA3 and 6 allows us to consider the possibility that this hypothesis could be extended to other members of PDI. These elements invite future studies to decipher the exact role of these non-catalytic thiol-disulfide motifs in the functions of PDIs. Strategies that would allow to validate this hypothesis are discussed.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle