PP 8.13 – 00191 Investigating the Impact of CD4 mimetic BNM-III-170 on SHIV-infected Rhesus Macaques
Notice bibliographique
Résumé
Replication kinetics were monitored by p24 every 3 days.Every 14 days, target cells were replenished and cultures were tested for genotypic and phenotypic measures of bNAb resistance.This was accomplished by single genome sequencing env genes from the supernatant and using the remaining supernatant to spinoculate new CD4+ cells.The remaining infected cells were replenished with media containing no bNAb for 24 hours of virus production.This viral supernatant was then tested by neutralization assay for bNAb resistance.Results: We observed both common escape mutations previously published, but also novel escape mutations.Partial resistance to VRC01 began at day 30 followed by complete resistance by day 45.At which point mutations were observed in the CD4 contact site as well as the fusion peptide in antibody-only wells.Complete resistance to 10-1074 developed by day 45 due to the N332 glycan mutation.A repeat independent experiment confirmed partial resistance developed to both antibodies by day 30.Figure.Antibody Resistance at Day 45.Conclusions: Future experiments will expand viruses to multiple subtypes and bNAbs.This reproducible in vitro bNAb escape assay will lead to a deeper understanding of viral escape, to better inform the design of highly effective bNAb cocktails targeting multiple conserved sites.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,022 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».