Macrophage Scavenger Receptor 1 in the CSF pre‐symptomatic with a parental history of AD and in the cortex of autopsy‐confirmed Alzheimer’s Disease cases.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background The macrophage scavenger receptor 1 (MSR1) also known as SCARA1, is a gene that encodes for a macrophage/microglia cell surface receptor. Its primary function is to mediate the endocytosis of modified (acetylated or oxidized) low density lipoproteins (LDLs)(Frenkel, Wilkinson et al. 2013). Interestingly, MSR1 has been found to bind to soluble β‐amyloid (Aβ) and it is thought that it participates to its clearance via a microglia‐mediated process (PrabhuDas, Baldwin et al. 2017). Using multiple cohorts covering a wide range of brain health stages, MSR1 gene expression and protein level alterations were investigated to map the associations between MSR1 and Alzheimer’s disease (AD) pathophysiology. Method MSR1 CSF protein levels were assessed in the PREVENT‐AD (PRe‐symptomatic EValuation of Experimental or Novel Treatments for Alzheimer’s Disease) cohort which is composed of subjects with parental history of AD. MSR1 has been measured with a primer extension assay using Olink technology (J. Alz. Dis., In press). ELISA has been used to quantify the MSR1 protein levels in frontal cortex homogenates of 86 brains from the Douglas Bell Canada Brain Bank (DBCBB) whereas MSR1 mRNA prevalence was measured using Gene Chip Clarium D human microarray. All data compilation and statistical analysis has been made using JMP pro 15.1 software. Result Strong correlations between MSR1 CSF protein levels and CSF AD biomarkers, notably phosphorylated Tau (R2=0.108; p=0.0007) and Aβ42 (R2=0.055; p=0.0175) have been found in the PREVENT‐AD cohort. An APOEε4‐independent correlation was observed between CSF MSR1 and APOE (R2=0.156; p˂0.0001) in these cognitively unaffected subjects. In autopsy‐confirmed cortical homogenates, MSR1 protein levels display negative correlations with both Aβ plaques (R2=0.035; p=0.1768) and neurofibrillary tangles (R2=0.136; p=0.0067). On the other hand, MSR1 mRNA levels of the same samples are not correlated with plaques (R2=0.008; p=0.5255) and tangles (R2=0.009; p=0.4971) density. Studies are underway to contrast MSR1 levels with amyloid‐42, p(181)tau and total tau in the same tissues. Conclusion MSR1 plays a significant role in the pathophysiology of AD and recent evidence suggests that elevated MSR1 protein observed in the early stages of AD are followed by a progressive decline that coincides with the emergence of Tau pathology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».