Polymorphisms in the <i>WWOX</i> gene are associated with brain glucose metabolism and influence cerebrospinal fluid p‐tau181 levels
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Genome‐wide association studies (GWAS) studies can be a powerful tool for identifying new single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with multifactorial diseases. Previous GWAS have identified more than 20 genes as potential factors of genetic susceptibility in Alzheimer’s disease (AD). One of them is the protein coding gene WW Domain Containing Oxidoreductase (WWOX), which is highly expressed in mature astrocytes and neurons. Here, we investigated the association between WWOX SNPs, 18F‐FDG PET neuroimaging and cerebrospinal fluid (CSF) levels of tau phosphorylated at threonine 181 (p‐tau181) in elderly individuals from the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI). Methods Data was acquired from 537 participants (CU= 195; MCI= 314; AD= 28) of the ADNI database. The brain glucose metabolism was estimated using the standard uptake value ratio (SUVr, cerebellum as reference) of FDG‐PET. The presence of the SNPs were integrated to FDG PET images using voxel‐wise generalized linear regression models adjusted for age, gender, diagnostic status, and years of education (RMINC package). Through the Wilcoxon test we determined if the SNPs presence influenced p‐tau181 levels in CSF. All statistical analyzes were performed in the R statistical computing software (version 4.1.2) (significance level of p < 0.05). Results Sixty‐seven WWOX SNPs were statistically associated with 18F‐FDG PET signal. Voxel‐wise analyses demonstrated that the top ten WWOX SNPs with the highest number of voxels altered in the FDG‐PET images were associated with cortical hypermetabolism (Figure 1, top three). Thirteen WWOX SNPs were significantly associated with lower p‐tau181 concentration in the CSF, including rs7193539 (p = 0.0004), rs7206890 (p = 0.0061), and rs11859281 (p = 0.0009), compared to the reference genotype. Conclusion Several SNPs of the WWOX gene were significantly correlated to brain metabolism. The presence of the SNPs can influence p‐tau181 levels, suggesting a role of WWOX in AD, as reported in other previous studies. Our findings suggest a protective effect of these WWOX gene variants. Additional studies are needed to better understand the biological implications of our findings.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».