HIVEP3 variant is associated with increased amyloid deposition and lower hippocampal volume in cognitively unimpaired subjects.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background A GWAS performed in a Canadian cohort identified, for the first time, the polymorphism rs10493098 C in the HIVEP3 gene to be associated with increased risk for late‐onset Alzheimer’s disease (AD). HIVEP3 is a transcription factor that regulates inflammatory response, neuroregeneration, cell growth and apoptosis. In this project, we examined three different population cohorts (PREVENT‐AD, ROSMAP and ADNI cohorts) to investigate the role of the rs10493098 C polymorphism in the pathophysiology of AD. Method In the PREVENT‐AD cohort, 18F‐NAV4694 PET was used to measure amyloid burden, and participants were followed for at least four years. In the autopsied‐confirmed ROSMAP cohort, Aß load and NFT density in the cortex were measured by immunohistorychemistry. Participants were followed throughout most of their adult life, until death. In the ADNI cohort, hippocampal volume was assessed with magnetic resonance imaging, and we evaluated follow‐up for 1 year. Result In the Prevent‐AD cohort, participants who are homozygous for the HIVEP3 C variant had higher amyloid index score compared to non‐carriers (p=0.004) (Fig 1). There is an interaction between APOE4 and HIVEP3, and participants who are APOE4 positive and homozygous for the HIVEP3 C variant exhibit even higher amyloid deposition compared to non‐carriers (p<0.001) (Fig 1). Participants who are homozygous for the HIVEP3 C variant have a higher risk of having an amyloid positive scan than participants who are non‐carriers (p=0.04) (Fig 1). There was no association between the HIVEP3 rs10493098 C variant and Braak or Cerad stages in the ROSMAP population. In the ADNI cohort, considering only the participants who had normal cognition, subjects who are homozygous for the HIVEP3 rs10493098 C variant display lower right hippocampus volume compared to heterozygous and non‐carriers (p=0.032) (Fig 2). Conclusion The HIVEP3 rs10493098 C variant is associated with higher amyloid deposition and lower hippocampal volume in cognitively unimpaired individuals
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».