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Enregistrement W4312091521 · doi:10.1371/journal.pone.0279317

Cancer prevention in cancer predisposition syndromes: A protocol for testing the feasibility of building a hereditary cancer research registry and nurse navigator follow up model

2022· article· en· W4312091521 sur OpenAlexafffundabout
Holly Etchegary, April Pike, Rebecca Puddester, Mike Warren, Vanessa Francis, Michael O. Woods, Jane Green, Sevtap Savas, Melanie Seal, Zhiwei Gao, S. K. Avery, Fiona Curtis, Jerry McGrath, D.M. MACDONALD, T. Burry, Lesa Dawson

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensSt. John’s Health Sciences CentreNewfoundland and Labrador Centre for Applied Health ResearchMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésLynch syndromeMedicineCancerGenetic testingCancer registryFamily medicineMLH1Cancer preventionPenetranceGenetic counselingBioinformaticsInternal medicineColorectal cancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Monogenic, high penetrance syndromes, conferring an increased risk of malignancies in multiple organs, are important contributors to the hereditary burden of cancer. Early detection and risk reduction strategies in patients with a cancer predisposition syndrome can save their lives. However, despite evidence supporting the benefits of early detection and risk reduction strategies, most Canadian jurisdictions have not implemented programmatic follow up of these patients. In our study site in the province of Newfoundland and Labrador (NL), Canada, there is no centralized, provincial registry of high-risk individuals. There is no continuity or coordination of care providing cancer genetics expertise and no process to ensure that patients are referred to the appropriate specialists or risk management interventions. This paper describes a study protocol to test the feasibility of obtaining and analyzing patient risk management data, specifically patients affected by hereditary breast ovarian cancer syndrome (HBOC; BRCA 1 and BRCA 2 genes) and Lynch syndrome (LS; MLH1, MSH2, MSH6, and PMS2 genes). Through a retrospective cohort study, we will describe these patients' adherence to risk management guidelines and test its relationship to health outcomes, including cancer incidence and stage. Through a qualitative interviews, we will determine the priorities and preferences of patients with any inherited cancer mutation for a follow up navigation model of risk management. Study data will inform a subsequent funding application focused on creating and evaluating a research registry and follow up nurse navigation model. It is not currently known what proportion of cancer mutation carriers are receiving care according to guidelines. Data collected in this study will provide clinical uptake and health outcome information so gaps in care can be identified. Data will also provide patient preference information to inform ongoing and planned research with cancer mutation carriers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,148
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,114
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,148
Score d'incertitude au seuil0,785

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1480,114
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0090,003
Communication savante0,0030,004
Science ouverte0,0050,005
Intégrité de la recherche0,0050,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0560,012

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,206
Tête enseignante GPT0,432
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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