Clinical severity of Omicron subvariants BA.1, BA.2, and BA.5 in a population‐based cohort study in British Columbia, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The SARS‐CoV‐2 variant Omicron emerged in late 2021. In British Columbia (BC), Canada, and globally, three genetically distinct subvariants of Omicron, BA.1, BA.2, and BA.5, emerged and became dominant successively within an 8‐month period. SARS‐CoV‐2 subvariants continue to circulate in the population, acquiring new mutations that have the potential to alter infectivity, immunity, and disease severity. Here, we report a propensity‐matched severity analysis from residents of BC over the course of the Omicron wave, including 39,237 individuals infected with BA.1, BA.2, or BA.5 based on paired high‐quality sequence data and linked to comprehensive clinical outcomes data between December 23, 2021 and August 31, 2022. Relative to BA.1, BA.2 cases were associated with a 15% and 28% lower risk of hospitalization and intensive care unit (ICU) admission (aHR hospital = 1.17; 95% confidence interval [CI] = 1.096–1.252; aHR ICU = 1.368; 95% CI = 1.152–1.624), whereas BA.5 infections were associated with an 18% higher risk of hospitalization (aHR hospital = 1.18; 95% CI = 1.133–1.224) after accounting for age, sex, comorbidities, vaccination status, geography, and social determinants of health. Phylogenetic analysis revealed no specific subclades associated with more severe clinical outcomes for any Omicron subvariant. In summary, BA.1, BA.2, and BA.5 subvariants were associated with differences in clinical severity, emphasizing how variant‐specific monitoring programs remain critical components of patient and population‐level public health responses as the pandemic continues.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».