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Enregistrement W4312143473 · doi:10.1016/j.bbadis.2022.166635

Organoids as a model to study intestinal and liver dysfunction in severe malnutrition

2022· article· en· W4312143473 sur OpenAlexafffund
José M. Horcas‐Nieto, Christian J. Versloot, Miriam Langelaar‐Makkinje, Albert Gerding, Tjasso Blokzijl, Mirjam H. Koster, Mirjam Baanstra, Ingrid A. Martini, Robert P. Coppes, Céline Bourdon, Sven C.D. van IJzendoorn, Peter Kim, Robert Bandsma, Barbara M. Bakker

Notice bibliographique

RevueBiochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiet and metabolism studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsHorizon 2020Canadian Institutes of Health ResearchEuropean CommissionStichting De Cock-Hadders
Mots-clésOrganoidMalnutritionBiologyPeroxisomeSteatosisPathophysiologyInternal medicineMedicineBioinformaticsEndocrinologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hospitalized children with severe malnutrition face high mortality rates and often suffer from hepatic and intestinal dysfunction, with negative impacts on their survival. New treatments cannot be developed without understanding the underlying pathophysiology. We have established and characterized translational organoid models of severe malnutrition of the liver and the intestine. In these models, amino acid starvation recapitulates the expected organ-specific functional changes (e.g., hepatic steatosis, barrier dysfunction) accompanied by reduced mitochondrial and peroxisomal proteins, and altered intestinal tight junction proteins. Re-supplementation of amino acids or pharmacological interventions with rapamycin or fenofibrate lead to partial recovery. Restoration of protein levels aligned with signs of improved peroxisomal function in both organoids, and increased mitochondrial proteins and tight junction protein claudin-3 in intestinal organoids. We present two organoid models as novel tools to gain mechanistic insights and to act as a testing platform for potential treatments for intestinal and hepatic dysfunction in severe malnutrition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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