Transcriptomics-based Analysis of the Response of Sugar Content in Litchi Pulp to Foliar Calcium Fertilizer Treatment
Notice bibliographique
Résumé
Ten 16-year-old trees were used as test materials to investigate the effect of foliar calcium fertilizer on the sugar content of ‘Feizixiao’ litchi ( Litchi chinensis Sonn.) pulp. The experiment began 35 days after anthesis (DAA) in 2020 and 2021, and the treatment was a foliar spray application of 0.3% CaCl 2 aqueous solution, whereas the control was a foliar spray application of water. The sugar content, sucrose-metabolizing enzymes, and ATP-dependent phosphofructokinase (PFK) activities in pulp were measured in 2020 and 2021. Transcriptome sequencing (RNA-seq) was performed on RNA samples from treatment and control fruit pulps at 35, 63, and 69 DAA (full mature stage) in 2020, and 10 genes were chosen for confirmation by real-time polymerase chain reaction (PCR) in 2020 and 2021. At full maturity, the soluble sugar content in the calcium-treated group was extremely significantly or significantly higher than that in the control group. After 63 DAA, the net sucrose-metabolizing enzyme activity in the calcium-treated group was significantly higher than that in the control group. Furthermore, at full maturity, the calcium-treated group had significantly higher sucrose synthase cleavage activity and significantly lower PFK activity than the control group. Fifty-four highly expressed genes in the glycolytic pathway (EMP) were screened from transcriptome data, including hexokinase, PFK, and pyruvate kinase genes; 87% of these genes were downregulated in the treatment group compared with the control group at 69 DAA in 2020. The linear regression between RNA-seq and real-time PCR results was significant in 2020 ( r = 0.9292) and 2021 ( r = 0.8889). When the fruit is fully ripe, calcium treatment increases net sucrose-metabolizing enzyme activity by increasing sucrose synthase cleavage activity, promoting the accumulation of reducing sugars, and it downregulates phosphofructokinase gene expression in EMP, promoting sugar accumulation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».