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Enregistrement W4312200891 · doi:10.1038/s41698-022-00335-y

Drug sensitivity profiling of 3D tumor tissue cultures in the pediatric precision oncology program INFORM

2022· article· en· W4312200891 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

Revuenpj Precision Oncology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBiocenter FinlandDeutsche KrebshilfeMinistry of Rural AffairsDeutschen Konsortium für Translationale KrebsforschungSyöpäsäätiöBundesministerium für GesundheitBundesministerium für Bildung und ForschungAcademy of FinlandHelsingin YliopistoAgence Nationale de la RechercheDeutsches Krebsforschungszentrum
Mots-clésPrecision oncologyMedicineOncologyPediatric oncologyClinical OncologyInternal medicineProfiling (computer programming)Food and drug administrationMedical physicsCancerPharmacologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The international precision oncology program INFORM enrolls relapsed/refractory pediatric cancer patients for comprehensive molecular analysis. We report a two-year pilot study implementing ex vivo drug sensitivity profiling (DSP) using a library of 75-78 clinically relevant drugs. We included 132 viable tumor samples from 35 pediatric oncology centers in seven countries. DSP was conducted on multicellular fresh tumor tissue spheroid cultures in 384-well plates with an overall mean processing time of three weeks. In 89 cases (67%), sufficient viable tissue was received; 69 (78%) passed internal quality controls. The DSP results matched the identified molecular targets, including BRAF, ALK, MET, and TP53 status. Drug vulnerabilities were identified in 80% of cases lacking actionable (very) high-evidence molecular events, adding value to the molecular data. Striking parallels between clinical courses and the DSP results were observed in selected patients. Overall, DSP in clinical real-time is feasible in international multicenter precision oncology programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,914
Score d'incertitude au seuil0,587

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,396
Écart entre enseignants0,369 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle