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Enregistrement W4312663714 · doi:10.1183/13993003.congress-2022.3080

Cell death and proliferation-related transcripts in lung allograft airway epithelial cells

2022· article· en· W4312663714 sur OpenAlexaff
O Mekhael, A Duong, B Renaud-Picard, T Daigneault, A Burman, S Moshkelgosha, S Juvet, T Martinu

Notice bibliographique

Revue03.02 - Airway cell biology and immunopathology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTransplantation: Methods and Outcomes
Établissements canadiensToronto General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLungCell growthCell biologyEpitheliumAirwayCellBiologyMedicineCancer researchPathologyInternal medicineGeneticsSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<b>Introduction:</b> For patients with end-stage lung diseases,the only&nbsp;solution is lung transplantation. However, the major barrier to long-term survival following lung transplantation is progressive scarring,termed chronic lung allograft dysfunction (CLAD). Ongoing rejection mediated by alloimmune responses along with&nbsp;loss of the airway lining “club cells” are hallmarks of CLAD fibrotic pathology. To date, whether alloimmune responses induce club cell death and/or aberrant proliferation leading to CLAD is yet to be elucidated. <b>Objective:</b> We aimed to assess whether club cell excessive death and/or reduced proliferation were detected after lung transplantation. <b>Method:</b> We used single cell RNA sequencing (scRNAseq) to establish transcriptomic signatures of allograft airway epithelial cell death and proliferation in one stable lung transplant recipient’s (LTR) airway brushing obtained 3 months post-transplant. <b>Result:</b> We have identified four club cell subclusters in a LTR’s airway brushing. Extrinsic apoptosis-related genes were preferentially upregulated in club cell subcluster 1 compared to other club cell subclusters and other epithelial and immune cells. Proliferation-related genes were downregulated in all club cell subclusters <b>(Fig.1)</b>. <b>Conclusion:</b> Our data suggest a relative upregulation of extrinsic apoptosis-related genes and a relative downregulation of proliferation-related genes in club cells found in a LTR’s airway brushing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,498
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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