Abstract 284: Transcriptional Profiling Of Human Abdominal Aortic Aneurysm Tissue Reveals Distinct Extracellular Vesicle-Derived MicroRNA Cargo
Notice bibliographique
Résumé
Aim: Abdominal aortic aneurysm (AAA) contributes to significant post-rupture mortality in aging populations. AAA management with watchful waiting and surgical repair is based on our limited understanding of disease processes, and current research foci including extracellular vesicles (EVs; nano-sized packages of proteins, RNAs, and lipids that facilitate intercellular communication) may aid in developing novel AAA therapies. To characterize this regulatory cargo, we isolated EVs from human AAA tissue or control aortic punch biopsies and profiled EV content with microRNA (miRNA) sequencing to identify dysregulated pathways. Methods: The study was approved by the University Health Network Research Ethics Board. EVs were isolated from human AAA or aortic punch tissue and enriched using size exclusion chromatography (SEC; qEVoriginal columns 70 nm, Izon Science Ltd.) (n=3). EV size and concentration were determined using nanoparticle tracking analysis (NTA; NanoSight NS300, Malvern Panalytical Ltd.). EV-miRNA sequencing was performed with Illumina NextSeq (HTG Molecular Diagnostics Inc.) and analyzed using Partek Genomics Suite (v.10) and MIENTURNET (19-11-25). Results: Patients were selected for infrarenal AAA requiring surgical repair (AAA) or coronary artery disease requiring bypass graft surgery (control). EV size and concentration were confirmed with NTA. Principal components and gene set analyses revealed distinct clustering of tissue types with 901 and 687 miRNAs enriched in AAA and control samples, respectively. Pathway prediction using established AAA miRNAs (e.g., miR-122, miR-146a, and miR-503) identified significant interactions with proaneurysmal signaling pathways (e.g., PI3K-AKT, JAK-STAT, and HIF-1) as well as cell senescence and adhesion processes (FDR < 0.05). Conclusion: EV-derived miRNAs from patients with AAA prominently associate with cell signaling, senescence, and adhesion pathways in aneurysm pathogenesis. To our knowledge, this is the first study to profile the EV-miRNA landscape in human AAA tissue. Further investigation will explore EV-miRNAs as mediators of communication between distinct vascular cell populations that contribute to AAA development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».