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Enregistrement W4312737130 · doi:10.1161/atvb.42.suppl_1.412

Abstract 412: Transcriptomic Analysis Reveals That Lipid Loading Of Distinct Intimal Myeloid Cell Subpopulations Precedes Inflammation In Early Atherogenesis

2022· article· en· W4312737130 sur OpenAlexaff
Corey A. Scipione, Sharon J. Hyduk, Chanele K. Polenz, Marwan G. Althagafi, Hisham M. Ibrahim, Sonya A. MacParland, Myron I. Cybulsky

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAtherosclerosis and Cardiovascular Diseases
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFoam cellInflammationBiologyMyeloidPopulationTranscriptomeMacrophageAortic archImmunologyMedicineInternal medicineAortaEndocrinologyCholesterolLipoproteinGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hypercholesterolemia (HC) is a key risk factor of atherosclerosis, a chronic inflammatory disease that causes myocardial infarction and stroke. Although all regions of arteries are exposed to HC, atherosclerosis develops in discrete regions, such as the lesser curvature (LC) of the mouse aortic arch. Dietary HC in Ldlr -/- mice induces intimal myeloid cells to develop into foam cells, constituting nascent lesions. The purpose of this study is to characterize the transcriptomic changes occurring in the aortic intima during the earliest stages of atherogenesis, and correlate them to cellular responses. Using en face enzymatic digestion and intimal cell microisolation, transcriptomic analysis was performed on the LC. Intimal cells were isolated from the LC of the ascending aortic arch of Ldlr -/- mice at 0, 5, and 14 days of CRD feeding. Bulk RNA-seq and RT-qPCR found that genes associated with lipid-loaded macrophages (e.g., Abcg1, Lgals3 ) were progressively elevated at 5 and 14 days of CRD. Atherogenesis-associated inflammatory transcripts and pathways, such as leukocyte transendothelial migration, cell adhesion, and cytokine/chemokine signalling were significantly elevated after 14d of CRD, but not detected at 5d. Single cell transcriptomic analysis of the mouse aortic arch intima of Ldlr -/- mice revealed multiple sub-populations of myeloid, endothelial, and other cell types. A shift in the C1qb + , Mmp12 + myeloid subpopulations was observed as the duration of cholesterol feeding increased - with expansion of a macrophage population rich in lipid-responsive transcripts. This finding is consistent with an increase in macrophage number and the presence of Nile Red + CD68 + foam cells observed by immunoconfocal microscopy at 5 days of CRD. However, a robust inflammatory signature was not detected in this macrophage cluster. Interestingly, an inflammatory signature similar to that reported in early atherogenesis was identified in a distinct Ccr2 + myeloid population with no signature of lipid loading. This suggests that the inflammation associated with atherogenesis may be a result of intercellular crosstalk between distinct myeloid subpopulations within the intima and may not originate directly from lipid loaded macrophages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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