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Enregistrement W4312813762 · doi:10.2196/38399

Predicting Openness of Communication in Families With Hereditary Breast and Ovarian Cancer Syndrome: Natural Language Processing Analysis

2022· article· en· W4312813762 sur OpenAlexvenueno aff
Vasiliki Baroutsou, Rodrigo C. G. Pena, Reka Schweighoffer, Maria Caiata Zufferey, Sue Kim, Sharlene Hesse‐Biber, Florina M. Ciorba, Gerhard Lauer, Maria C. Katapodi

Notice bibliographique

RevueJMIR Formative Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSwiss Cancer Research FoundationUniversität Basel
Mots-clésOpenness to experienceSentiment analysisContext (archaeology)Breast cancerInterpersonal communicationLexiconPsychologyMedicineCancerSocial psychologyArtificial intelligenceComputer scienceBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In health care research, patient-reported opinions are a critical element of personalized medicine and contribute to optimal health care delivery. The importance of integrating natural language processing (NLP) methods to extract patient-reported opinions has been gradually acknowledged over the past years. One form of NLP is sentiment analysis, which extracts and analyses information by detecting feelings (thoughts, emotions, attitudes, etc) behind words. Sentiment analysis has become particularly popular following the rise of digital interactions. However, NLP and sentiment analysis in the context of intrafamilial communication for genetic cancer risk is still unexplored. Due to privacy laws, intrafamilial communication is the main avenue to inform at-risk relatives about the pathogenic variant and the possibility of increased cancer risk. OBJECTIVE: The study examined the role of sentiment in predicting openness of intrafamilial communication about genetic cancer risk associated with hereditary breast and ovarian cancer (HBOC) syndrome. METHODS: We used narratives derived from 53 in-depth interviews with individuals from families that harbor pathogenic variants associated with HBOC: first, to quantify openness of communication about cancer risk, and second, to examine the role of sentiment in predicting openness of communication. The interviews were conducted between 2019 and 2021 in Switzerland and South Korea using the same interview guide. We used NLP to extract and quantify textual features to construct a handcrafted lexicon about interpersonal communication of genetic testing results and cancer risk associated with HBOC. Moreover, we examined the role of sentiment in predicting openness of communication using a stepwise linear regression model. To test model accuracy, we used a split-validation set. We measured the performance of the training and testing model using area under the curve, sensitivity, specificity, and root mean square error. RESULTS: Higher "openness of communication" scores were associated with higher overall net sentiment score of the narrative, higher fear, being single, having nonacademic education, and higher informational support within the family. Our results demonstrate that NLP was highly effective in analyzing unstructured texts from individuals of different cultural and linguistic backgrounds and could also reliably predict a measure of "openness of communication" (area under the curve=0.72) in the context of genetic cancer risk associated with HBOC. CONCLUSIONS: Our study showed that NLP can facilitate assessment of openness of communication in individuals carrying a pathogenic variant associated with HBOC. Findings provided promising evidence that various features from narratives such as sentiment and fear are important predictors of interpersonal communication and self-disclosure in this context. Our approach is promising and can be expanded in the field of personalized medicine and technology-mediated communication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,341 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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