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Enregistrement W4313332390 · doi:10.1101/2022.12.24.22283807

Simulation-based power analysis could improve the design of clinical trials in Alzheimer’s disease

2022· preprint· en· W4313332390 sur OpenAlexafffund
Daniel Andrews, Douglas L. Arnold, Danilo Bzdok, Simon Ducharme, Howard Chertkow, D. Louis Collins

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineEconomics, Econometrics and Finance
ThématiqueHealth Systems, Economic Evaluations, Quality of Life
Établissements canadiensBaycrest HospitalUniversity of TorontoMontreal Neurological Institute and HospitalMila - Quebec Artificial Intelligence InstituteNeuroRx Research (Canada)Douglas Mental Health University InstituteMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFondation Brain CanadaMcGill University
Mots-clésNormalitySample size determinationClinical trialDiseaseEconometricsStatistical powerPower analysisClinical study designSample (material)StatisticsDrug trialMedicineComputer sciencePsychologyMathematicsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Clinical trials of new treatments in different progressive diseases use power analysis to determine the sample size needed for a trial to obtain a statistically significant estimate for an anticipated treatment effect. In trials with parallel designs, the standard power analysis approach is based on a two-sample t-test. For example, the standard t-test approach was used in determining the sample size for the Phase 3 trials of aducanumab, the first drug approved by the United States Food and Drug Administration (FDA) to potentially slow cognitive decline in early-stage Alzheimer’s disease. However, t-tests contain normality assumptions, and t-test-based power analyses do not implicitly factor in the uncertainty about anticipated treatment effects that arises due to inter-subject heterogeneity in disease progression. These limitations may lead to recommended sample sizes that are too small, potentially making a trial blind to a treatment effect that is truly present if the cohort’s endpoints are not normally distributed and/or the anticipated treatment effect is overestimated. To address these issues, we present a novel power analysis method that (1) simulates clinical trials in a progressive disease using real-world data, (2) accounts for inter-subject heterogeneity in disease progression, and (3) does not depend on normality assumptions. As a showcase example, we used our method to calculate power for a range of sample sizes and treatment effects in simulated trials similar to the Phase 3 aducanumab trials EMERGE and ENGAGE. As expected, our results show that power increases with number of subjects and treatment effect (here defined as the cohort-level percent reduction in the rate of cognitive decline in treated subjects vs. controls). However, inclusion of realistic inter-subject heterogeneity in cognitive decline trajectories leads to increased sample size recommendations compared to a standard t-test power analysis. These results suggest that the sample sizes recommended by the t-test power analyses in the EMERGE and ENGAGE Statistical Analysis Plans were possibly too small to ensure a high probability of detecting the anticipated treatment effect. Insufficient sample sizes could partly explain the statistically significant effect of aducanumab being detected only in EMERGE. We also used our method to analyze power in simulated trials similar the Phase 3 lecanemab trial Clarity AD. Our results suggest that Clarity AD was adequately powered, and that power may be influenced by a trial’s number of analysis visits and the characteristics of subgroups within a cohort. By using our simulation-based power analysis approach, clinical trials of treatments in Alzheimer’s disease and potentially in other progressive diseases could obtain sample size recommendations that account for heterogeneity in disease progression and uncertainty in anticipated treatment effects. Our approach avoids the limitations of t-tests and thus could help ensure that clinical trials are more adequately powered to detect the treatment effects they seek to measure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,083
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,326
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,083
Score d'incertitude au seuil0,438

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0830,326
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,732
Tête enseignante GPT0,570
Écart entre enseignants0,163 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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