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Enregistrement W4313332741 · doi:10.1073/pnas.2203228120

Evolvability and trait function predict phenotypic divergence of plant populations

2022· article· en· W4313332741 sur OpenAlexaff
Øystein H. Opedal, W. Scott Armbruster, Thomas F. Hansen, Agnes Holstad, Christophe Pélabon, Stefan Andersson, Diane R. Campbell, Christina M. Caruso, Lynda F. Delph, Christopher G. Eckert, Åsa Lankinen, Greg M. Walter, Jon Ågren, Geir H. Bolstad

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensQueen's UniversityUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNorges ForskningsrådVetenskapsrådetCrafoordska Stiftelsen
Mots-clésEvolvabilityBiologyEvolutionary biologyTraitDivergence (linguistics)Genetic divergenceAdaptation (eye)PopulationOutcrossingQuantitative geneticsOutbreeding depressionInbreedingGenetic variationGeneticsEcologyGenetic diversityGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding the causes and limits of population divergence in phenotypic traits is a fundamental aim of evolutionary biology, with the potential to yield predictions of adaptation to environmental change. Reciprocal transplant experiments and the evaluation of optimality models suggest that local adaptation is common but not universal, and some studies suggest that trait divergence is highly constrained by genetic variances and covariances of complex phenotypes. We analyze a large database of population divergence in plants and evaluate whether evolutionary divergence scales positively with standing genetic variation within populations (evolvability), as expected if genetic constraints are evolutionarily important. We further evaluate differences in divergence and evolvability-divergence relationships between reproductive and vegetative traits and between selfing, mixed-mating, and outcrossing species, as these factors are expected to influence both patterns of selection and evolutionary potentials. Evolutionary divergence scaled positively with evolvability. Furthermore, trait divergence was greater for vegetative traits than for floral (reproductive) traits, but largely independent of the mating system. Jointly, these factors explained ~40% of the variance in evolutionary divergence. The consistency of the evolvability-divergence relationships across diverse species suggests substantial predictability of trait divergence. The results are also consistent with genetic constraints playing a role in evolutionary divergence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,154 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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